174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03310 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03310  urease, beta subunit  100 
 
 		 105 aa  209  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3203  urease, beta subunit  57.28 
 
 		 103 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000313456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  54.9 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6440  urease, beta subunit  58.16 
 
 		 122 aa  120  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290036  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0833  urease subunit beta  55.88 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  53.47 
 
 		 101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5694  urease, beta subunit  56.31 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  53.47 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0507  urease, beta subunit  58 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3528  urease, beta subunit  57.69 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.603861  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03430  urease, beta subunit  59 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2772  urease subunit beta  55.34 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  55.88 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  52.48 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  55.45 
 
 		 101 aa  114  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  55.45 
 
 		 101 aa  114  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4242  urease, beta subunit  57.43 
 
 		 101 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  52.43 
 
 		 136 aa  113  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  52.43 
 
 		 136 aa  113  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  51.46 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  55.34 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  50.49 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  52.94 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1351  urease subunit beta  55.88 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.568363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  52.48 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1077  urease subunit beta  55.45 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0386  urease, beta subunit  56.44 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1209  urease, beta subunit  53.47 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3400  urease subunit beta  57.43 
 
 		 101 aa  110  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.180648  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0955  urease, beta subunit  51.49 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1026  urease, beta subunit  53.4 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447798 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0975  urease subunit beta  55.45 
 
 		 101 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4007  urease subunit beta  53.47 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793578  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1727  urease, beta subunit  56.57 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  53.47 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0391  urease, beta subunit  54.9 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2012  urease, beta subunit  52.94 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  50 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2489  urease subunit beta  53.47 
 
 		 101 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.832851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0986  urease subunit beta  54.46 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0582515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  53.47 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0220  urease  50.51 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.773173 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  53.47 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  53.47 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0929  urease, beta subunit  50.5 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  53.47 
 
 		 101 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  49.5 
 
 		 101 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2368  urease subunit beta  51.49 
 
 		 101 aa  107  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.569035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0791  urease subunit beta  52.48 
 
 		 101 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1322  urease subunit beta  50.98 
 
 		 106 aa  106  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  52.43 
 
 		 105 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2256  urease subunit beta  52.43 
 
 		 106 aa  105  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1768  urease, beta subunit  48.51 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3693  urease, beta subunit  50.5 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944796  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0780  urease subunit beta  52.48 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2183  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0994  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0422  urease subunit beta  51.49 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0901  urease subunit beta  51.49 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0724  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1862  urease, beta subunit  49.5 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779138  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2558  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3111  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2056  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3938  urease, beta subunit  52.43 
 
 		 117 aa  104  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3075  urease subunit beta  49.5 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1183  urease, beta subunit  53.47 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  51.96 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3134  urease, beta/gamma subunit  50.5 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  52.48 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0668  urease subunit beta  53.92 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  52 
 
 		 257 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  53.47 
 
 		 206 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  54.17 
 
 		 228 aa  103  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0871  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1497  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0881  urease subunit beta  50.49 
 
 		 111 aa  103  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.590043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2993  urease, beta subunit  50.5 
 
 		 101 aa  103  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  48.04 
 
 		 106 aa  103  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2994  urease subunit beta  50.98 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  49.5 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2033  urease subunit beta protein  48.51 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279697  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  52.48 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2306  urease subunit beta  49.51 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  50.5 
 
 		 206 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0324  urease subunit beta  52.43 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00761079  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  50 
 
 		 206 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  50 
 
 		 206 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  50 
 
 		 206 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  49 
 
 		 206 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  49.5 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  50 
 
 		 206 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0693  urease subunit beta  49.5 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4894  urease, beta subunit  50 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  51.49 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4435  urease subunit beta  49.5 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.635744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0581  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0726  urease, beta subunit  46.6 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3555  urease subunit beta  51.04 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.417484  normal  0.122959 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>