174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6440 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6440  urease, beta subunit  100 
 
 		 122 aa  239  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290036  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3203  urease, beta subunit  71.58 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000313456  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0507  urease, beta subunit  73.91 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0833  urease subunit beta  67.39 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  67.39 
 
 		 101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  67.39 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  60.82 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  60.82 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  64.89 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  64.21 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  67.37 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  60.61 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  63.16 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  65.59 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  64.21 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  62.77 
 
 		 101 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  65.59 
 
 		 206 aa  120  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1026  urease, beta subunit  61.76 
 
 		 103 aa  120  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447798 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  65.59 
 
 		 206 aa  120  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03310  urease, beta subunit  58.16 
 
 		 105 aa  120  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  57.45 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2256  urease subunit beta  66.32 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  63.44 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  65.59 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2756  urease, beta subunit  61.32 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2306  urease subunit beta  61.7 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2683  urease, beta subunit  67.39 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2772  urease subunit beta  58.33 
 
 		 111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2994  urease subunit beta  61.05 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0391  urease, beta subunit  60.95 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  64.52 
 
 		 206 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2012  urease, beta subunit  64.52 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5694  urease, beta subunit  66.3 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.84 
 
 		 231 aa  116  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  58.33 
 
 		 106 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  58.33 
 
 		 106 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5113  urease, beta subunit  64.29 
 
 		 136 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.755356 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2368  urease subunit beta  63.27 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.569035 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  52.88 
 
 		 136 aa  115  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  52.88 
 
 		 136 aa  115  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0190  urease, beta subunit  60.38 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  65.62 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  63.44 
 
 		 206 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  68.13 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0386  urease, beta subunit  67.03 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1209  urease, beta subunit  63.04 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  58.82 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  59.57 
 
 		 101 aa  114  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  66.67 
 
 		 101 aa  114  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0881  urease subunit beta  58.95 
 
 		 111 aa  114  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.590043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2806  urease, beta subunit  57.94 
 
 		 105 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0478999  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2850  urease, beta subunit  57.94 
 
 		 105 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  66.67 
 
 		 101 aa  114  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2833  urease, beta subunit  57.94 
 
 		 105 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  60.78 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  59.57 
 
 		 101 aa  114  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  63.27 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1322  urease subunit beta  60.22 
 
 		 106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  60.38 
 
 		 113 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0986  urease subunit beta  65.59 
 
 		 101 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0582515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  57.84 
 
 		 117 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  62.37 
 
 		 206 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  56.38 
 
 		 101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  62.11 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1470  urease, beta subunit  60.71 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  61.29 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1308  urease, beta subunit  60.71 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.321935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  60.82 
 
 		 208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  55.66 
 
 		 206 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4435  urease subunit beta  58.95 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.635744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  61.05 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00888  probable urease (beta subunit) protein  54.74 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1768  urease, beta subunit  57.89 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2993  urease, beta subunit  54.26 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  58.76 
 
 		 231 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0220  urease  56.84 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.773173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.24 
 
 		 231 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3083  urease, beta subunit  62.64 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1183  urease, beta subunit  59.46 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0791  urease subunit beta  63.44 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4894  urease, beta subunit  58.95 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0780  urease subunit beta  63.44 
 
 		 101 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  63.44 
 
 		 101 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  56.6 
 
 		 840 aa  110  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0693  urease subunit beta  58.95 
 
 		 101 aa  110  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  63.44 
 
 		 101 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3353  urease, beta subunit  57.14 
 
 		 105 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.880629  normal  0.518335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  54.05 
 
 		 231 aa  110  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  57.89 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0581  urease subunit beta  58.95 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.88 
 
 		 231 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  55.67 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0688  urease subunit beta  51.89 
 
 		 106 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3465  urease subunit beta  55.79 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00430973  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0955  urease, beta subunit  55.79 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2033  urease subunit beta protein  61.05 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279697  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  67.06 
 
 		 257 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03430  urease, beta subunit  58.33 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2489  urease subunit beta  63.44 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.832851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  60.22 
 
 		 206 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>