More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2863 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  100 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  89.32 
 
 		 206 aa  370  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  87.86 
 
 		 206 aa  368  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  87.86 
 
 		 206 aa  367  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  86.41 
 
 		 206 aa  358  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  85.92 
 
 		 206 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  77.18 
 
 		 206 aa  325  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  75.24 
 
 		 206 aa  316  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  57.14 
 
 		 231 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.24 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.24 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.47 
 
 		 231 aa  214  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.81 
 
 		 231 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  52.91 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  51.64 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.17 
 
 		 231 aa  204  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.44 
 
 		 257 aa  204  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  51.49 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  52.36 
 
 		 228 aa  188  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  47.6 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  42.54 
 
 		 248 aa  181  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0332  urease subunit gamma  86 
 
 		 100 aa  174  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474292  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  84 
 
 		 100 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0985  urease subunit gamma  82 
 
 		 100 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2681  urease, gamma subunit  87 
 
 		 100 aa  170  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.399817  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2369  urease subunit gamma  81 
 
 		 100 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.437343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0387  urease subunit gamma  81 
 
 		 100 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  43.35 
 
 		 833 aa  169  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1745  urease, gamma subunit  80 
 
 		 100 aa  169  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  0.727576 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1025  urease, gamma subunit  81 
 
 		 100 aa  169  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1211  urease, gamma subunit  78.64 
 
 		 103 aa  168  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1800  urease subunit gamma  79 
 
 		 100 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4185  urease subunit gamma  80 
 
 		 100 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6167  urease, beta subunit  45.93 
 
 		 247 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.018331 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1954  urease subunit gamma  81 
 
 		 100 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0268  urease subunit gamma  82 
 
 		 100 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0309  urease subunit gamma  81 
 
 		 100 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.510674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3696  urease, gamma subunit  80 
 
 		 100 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3504  urease subunit gamma  79 
 
 		 100 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0282  urease subunit gamma  82 
 
 		 100 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113858  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  43.97 
 
 		 836 aa  165  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  78 
 
 		 100 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3056  urease subunit gamma  80 
 
 		 100 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  52.13 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3312  urease subunit gamma  79 
 
 		 100 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  42.48 
 
 		 878 aa  160  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1706  urease, gamma subunit  77 
 
 		 100 aa  156  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2611  urease subunit gamma  51.87 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.158041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2013  urease, gamma subunit  77 
 
 		 100 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  40.16 
 
 		 840 aa  152  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2768  bifunctional urease subunit gamma/beta  47.59 
 
 		 190 aa  151  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  43.81 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3464  urease subunit gamma  76.77 
 
 		 100 aa  149  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000536162  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.75 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2443  urease, gamma subunit  75.76 
 
 		 100 aa  148  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.972396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7012  urease gamma subunit  83.72 
 
 		 86 aa  148  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451916  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  72 
 
 		 100 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  71.72 
 
 		 100 aa  147  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  72.28 
 
 		 101 aa  147  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  69 
 
 		 100 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  144  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1185  urease, gamma subunit  74.75 
 
 		 100 aa  144  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0508  urease, gamma subunit  73.74 
 
 		 100 aa  144  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  73.74 
 
 		 100 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4891  urease, gamma subunit  72.73 
 
 		 100 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  73.74 
 
 		 100 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  73.74 
 
 		 100 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  73.74 
 
 		 100 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  73.74 
 
 		 100 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  73.74 
 
 		 100 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  73.74 
 
 		 100 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0834  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.28 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64350  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5586  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  73.74 
 
 		 100 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  71.72 
 
 		 100 aa  142  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  68.69 
 
 		 100 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1498  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.791581  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  69 
 
 		 100 aa  142  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  72.73 
 
 		 100 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  69 
 
 		 101 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  72.73 
 
 		 100 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1769  urease subunit gamma  72.73 
 
 		 100 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0584  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  141  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2625  urease subunit gamma  66 
 
 		 100 aa  141  5e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7363  normal  0.529146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0834  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 122 aa  142  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  63 
 
 		 100 aa  141  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  141  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  140  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4008  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  140  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.721691  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2255  urease subunit gamma  67 
 
 		 100 aa  141  9e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0423  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0781  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  140  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0902  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5693  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 114 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09900  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.587773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  69 
 
 		 104 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  72.73 
 
 		 100 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0872  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>