173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0985 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0985  urease subunit gamma  100 
 
 		 100 aa  202  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0309  urease subunit gamma  96 
 
 		 100 aa  196  9e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.510674  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1954  urease subunit gamma  96 
 
 		 100 aa  196  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2369  urease subunit gamma  87 
 
 		 100 aa  186  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.437343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1211  urease, gamma subunit  86 
 
 		 103 aa  181  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1745  urease, gamma subunit  82 
 
 		 100 aa  177  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  0.727576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  83 
 
 		 206 aa  175  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0332  urease subunit gamma  82 
 
 		 100 aa  174  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1800  urease subunit gamma  79 
 
 		 100 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3504  urease subunit gamma  79 
 
 		 100 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3696  urease, gamma subunit  81 
 
 		 100 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  82 
 
 		 206 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  79 
 
 		 100 aa  170  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2681  urease, gamma subunit  82 
 
 		 100 aa  170  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.399817  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  81 
 
 		 206 aa  169  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  81 
 
 		 206 aa  169  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4185  urease subunit gamma  78 
 
 		 100 aa  169  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3056  urease subunit gamma  81 
 
 		 100 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3312  urease subunit gamma  81 
 
 		 100 aa  168  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0282  urease subunit gamma  79 
 
 		 100 aa  167  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113858  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  78 
 
 		 100 aa  167  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  82 
 
 		 206 aa  167  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0268  urease subunit gamma  78 
 
 		 100 aa  166  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  80 
 
 		 206 aa  166  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1025  urease, gamma subunit  76 
 
 		 100 aa  165  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452528 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0387  urease subunit gamma  78 
 
 		 100 aa  164  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  79 
 
 		 206 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  76 
 
 		 206 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2013  urease, gamma subunit  75 
 
 		 100 aa  156  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1706  urease, gamma subunit  74 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513247 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3464  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  143  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000536162  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0508  urease, gamma subunit  70.71 
 
 		 100 aa  143  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7012  urease gamma subunit  75.58 
 
 		 86 aa  141  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451916  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2625  urease subunit gamma  65 
 
 		 100 aa  140  8e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7363  normal  0.529146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64350  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5586  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2255  urease subunit gamma  64 
 
 		 100 aa  137  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  66.67 
 
 		 100 aa  137  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4411  urease, gamma subunit  65 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  64 
 
 		 100 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0584  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  135  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4891  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  64 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0182  urease subunit gamma  66 
 
 		 100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19241  urease subunit gamma  62 
 
 		 100 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.473665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2443  urease, gamma subunit  64.65 
 
 		 100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.972396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09900  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.587773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0695  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  65 
 
 		 100 aa  134  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  66.67 
 
 		 100 aa  134  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1185  urease, gamma subunit  65.66 
 
 		 100 aa  133  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2882  urease  65.66 
 
 		 100 aa  133  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1053  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  63 
 
 		 100 aa  133  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  62.63 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  59 
 
 		 100 aa  131  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  131  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0746  urease, gamma subunit  60.61 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29791  urease subunit gamma  62 
 
 		 100 aa  131  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  64.65 
 
 		 100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0954  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4432  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.988903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  62 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0880  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2415  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0834  urease subunit gamma  65.98 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0834  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1769  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  130  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1321  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  130  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2035  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.16208  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2187  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  62.63 
 
 		 100 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2271  urease subunit gamma  59 
 
 		 100 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1864  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.436059 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0699  urease, gamma subunit  64.65 
 
 		 100 aa  129  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0516736  hitchhiker  0.0000000372935 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0479  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00887  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3411  urease, gamma subunit  64.65 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1729  urease, gamma subunit  62.63 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5693  urease subunit gamma  64.95 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0988  urease, gamma subunit  60.61 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  62.63 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  59.6 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 100 aa  127  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0323  urease subunit gamma  58 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000292656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  59 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4240  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  127  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  59.6 
 
 		 100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>