More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1260 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.94 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  52.19 
 
 		 257 aa  251  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  50 
 
 		 833 aa  224  8e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  45 
 
 		 840 aa  216  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.07 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  45.77 
 
 		 836 aa  211  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  46.43 
 
 		 878 aa  210  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  43.82 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  47.39 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  45.71 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  46.93 
 
 		 231 aa  201  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  46.4 
 
 		 208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  48 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  46.93 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  45.7 
 
 		 206 aa  191  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  43.42 
 
 		 206 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  43.04 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  43.48 
 
 		 206 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  43.42 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  43.42 
 
 		 206 aa  184  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  43.42 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  42.54 
 
 		 206 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  41.67 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  39.68 
 
 		 215 aa  173  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6167  urease, beta subunit  37.25 
 
 		 247 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.018331 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  40.32 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2768  bifunctional urease subunit gamma/beta  41.71 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  34.65 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2611  urease subunit gamma  41.01 
 
 		 200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.158041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4837  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  62 
 
 		 100 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  62.63 
 
 		 100 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  56 
 
 		 100 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2454  urease, gamma subunit  60.61 
 
 		 100 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0725  urease, gamma subunit  59 
 
 		 100 aa  126  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0880  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1472  urease, gamma subunit  58.59 
 
 		 100 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  55 
 
 		 100 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1185  urease, gamma subunit  54 
 
 		 100 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1498  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.791581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4411  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 112 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0872  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3938  urease, beta subunit  55.36 
 
 		 117 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3399  urease subunit gamma  56 
 
 		 100 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4008  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.721691  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  67.03 
 
 		 101 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0423  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0781  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0902  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  35.48 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0746  urease, gamma subunit  54.55 
 
 		 108 aa  122  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  56.6 
 
 		 122 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  55 
 
 		 100 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  60.61 
 
 		 105 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  52.53 
 
 		 100 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 101 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09900  urease subunit gamma  55 
 
 		 100 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.587773  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0182  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0268  urease, gamma subunit  57 
 
 		 100 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3664  urease, gamma subunit  54.55 
 
 		 100 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  60.61 
 
 		 101 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1429  urease, gamma subunit region  53.54 
 
 		 100 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2271  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  59.6 
 
 		 101 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2882  urease  53 
 
 		 100 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6439  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691822  normal  0.288199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5586  urease subunit gamma  55 
 
 		 100 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1352  urease subunit gamma  53 
 
 		 100 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  54 
 
 		 100 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64350  urease subunit gamma  55 
 
 		 100 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  60.61 
 
 		 105 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0930  urease subunit gamma  52.53 
 
 		 100 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  59.6 
 
 		 117 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4432  urease subunit gamma  54 
 
 		 100 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.988903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  59.79 
 
 		 113 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  57.58 
 
 		 105 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0994  urease subunit beta  59.6 
 
 		 101 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  62.89 
 
 		 101 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  54 
 
 		 100 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  53 
 
 		 100 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  62.89 
 
 		 101 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  61.86 
 
 		 101 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0695  urease subunit gamma  54 
 
 		 100 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2187  urease subunit gamma  52 
 
 		 100 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1864  urease subunit gamma  52 
 
 		 100 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.436059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  60.61 
 
 		 105 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2035  urease subunit gamma  54 
 
 		 100 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.16208  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08931  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>