More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0056 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  50.9 
 
 		 231 aa  222  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.8 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.12 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.95 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.71 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.95 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.46 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  52.86 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6167  urease, beta subunit  49.78 
 
 		 247 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.018331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  53.05 
 
 		 206 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  53.77 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  50 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  51.17 
 
 		 206 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  52.36 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  51.18 
 
 		 206 aa  184  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  51.18 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.33 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  41.67 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  52.66 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  40.43 
 
 		 833 aa  168  6e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  44.63 
 
 		 257 aa  167  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  40.34 
 
 		 836 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  42.99 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  42.91 
 
 		 257 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  36.14 
 
 		 878 aa  156  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  46.53 
 
 		 208 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0834  bifunctional urease subunit gamma/beta  52 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  48.88 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  37.34 
 
 		 840 aa  137  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  57.66 
 
 		 142 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2611  urease subunit gamma  48.17 
 
 		 200 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.158041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2768  bifunctional urease subunit gamma/beta  46.88 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2772  urease subunit beta  56.44 
 
 		 111 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  69.32 
 
 		 105 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1768  urease, beta subunit  55.56 
 
 		 102 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2453  urease, beta subunit  58 
 
 		 130 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  58 
 
 		 104 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  49.53 
 
 		 122 aa  118  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  50.96 
 
 		 133 aa  118  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  64.37 
 
 		 101 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1026  urease, beta subunit  63.74 
 
 		 103 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  57.58 
 
 		 101 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  58.59 
 
 		 101 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3555  urease subunit beta  53.26 
 
 		 158 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.417484  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  55.06 
 
 		 106 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  55.06 
 
 		 106 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  56 
 
 		 104 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1132  urease subunit beta  53.26 
 
 		 158 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.273178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4894  urease, beta subunit  56 
 
 		 102 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  56.57 
 
 		 101 aa  115  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1078  urease subunit beta  47.83 
 
 		 144 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4435  urease subunit beta  55.56 
 
 		 101 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.635744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4007  urease subunit beta  64.77 
 
 		 101 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793578  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64370  urease subunit beta  58.59 
 
 		 101 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0422  urease subunit beta  64.37 
 
 		 101 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0901  urease subunit beta  64.37 
 
 		 101 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  60.23 
 
 		 106 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08941  urease subunit beta  54.26 
 
 		 106 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.349786  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0693  urease subunit beta  55.56 
 
 		 101 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  51.04 
 
 		 136 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  54.55 
 
 		 101 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0835  urease subunit beta  54.26 
 
 		 106 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  51.04 
 
 		 136 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0871  urease subunit beta  63.22 
 
 		 101 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  53.33 
 
 		 102 aa  112  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  54.26 
 
 		 106 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3465  urease subunit beta  51 
 
 		 106 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00430973  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0791  urease subunit beta  62.07 
 
 		 101 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2183  urease subunit beta  63.22 
 
 		 101 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2489  urease subunit beta  62.07 
 
 		 101 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.832851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0581  urease subunit beta  54.55 
 
 		 101 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0724  urease subunit beta  63.22 
 
 		 101 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2056  urease subunit beta  63.22 
 
 		 101 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2558  urease subunit beta  63.22 
 
 		 101 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  58.43 
 
 		 101 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0780  urease subunit beta  62.07 
 
 		 101 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4223  urease, beta subunit  61.11 
 
 		 102 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816788  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3111  urease subunit beta  63.22 
 
 		 101 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  52.08 
 
 		 164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  52.08 
 
 		 159 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  56.67 
 
 		 108 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3134  urease, beta/gamma subunit  62.5 
 
 		 132 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  59.77 
 
 		 101 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0391  urease, beta subunit  54 
 
 		 117 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4836  urease, beta subunit  41.96 
 
 		 122 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0921761  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03430  urease, beta subunit  54 
 
 		 144 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  52.43 
 
 		 105 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3075  urease subunit beta  62.07 
 
 		 101 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5588  urease subunit beta  56.57 
 
 		 101 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  57.3 
 
 		 101 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1497  urease subunit beta  62.07 
 
 		 101 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  57.3 
 
 		 101 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  58.06 
 
 		 105 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00888  probable urease (beta subunit) protein  56.32 
 
 		 102 aa  109  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  56.99 
 
 		 117 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  52.43 
 
 		 105 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2033  urease subunit beta protein  60.92 
 
 		 101 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279697  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5113  urease, beta subunit  57.14 
 
 		 136 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.755356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2442  urease, beta subunit  50.51 
 
 		 101 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.549938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>