More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1553 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  100 
 
 		 234 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6167  urease, beta subunit  73.59 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.018331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0834  bifunctional urease subunit gamma/beta  73.82 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  47.64 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  48.94 
 
 		 231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.51 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  45.37 
 
 		 215 aa  191  6e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  53.55 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  52.13 
 
 		 206 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  52.38 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  52.38 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  47.26 
 
 		 232 aa  185  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  52.61 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  50.94 
 
 		 206 aa  184  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.43 
 
 		 231 aa  184  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  46.3 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  50 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  50.72 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  48.8 
 
 		 206 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.57 
 
 		 231 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.07 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  45.59 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  48.88 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  43.67 
 
 		 840 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  37.4 
 
 		 836 aa  150  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  36.44 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2768  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.74 
 
 		 190 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27452  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  37.45 
 
 		 833 aa  144  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.94 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  45.85 
 
 		 208 aa  141  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  35.71 
 
 		 878 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2611  urease subunit gamma  51.05 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.158041 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2454  urease, gamma subunit  55.56 
 
 		 100 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2068  urease, gamma subunit  54 
 
 		 102 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000614886  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 100 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  59.6 
 
 		 100 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6439  urease subunit gamma  58 
 
 		 100 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691822  normal  0.288199 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  57.14 
 
 		 142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4411  urease, gamma subunit  47.32 
 
 		 112 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  51.52 
 
 		 100 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  51.52 
 
 		 100 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0725  urease, gamma subunit  48.48 
 
 		 100 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0387  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2271  urease subunit gamma  50.51 
 
 		 100 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0872  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0880  urease subunit gamma  52.53 
 
 		 100 aa  108  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4008  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.721691  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0834  urease subunit gamma  47 
 
 		 100 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0423  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0781  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0902  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  53 
 
 		 100 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1498  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.791581  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0930  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0508  urease, gamma subunit  54 
 
 		 100 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1472  urease, gamma subunit  48.48 
 
 		 100 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08931  urease subunit gamma  47 
 
 		 100 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132639  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  49.49 
 
 		 100 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  47.47 
 
 		 100 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1869  urease subunit gamma  48.48 
 
 		 100 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1185  urease, gamma subunit  53.54 
 
 		 100 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08911  urease subunit gamma  46 
 
 		 100 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.81237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  48.48 
 
 		 100 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5693  urease subunit gamma  57.73 
 
 		 114 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4837  urease subunit gamma  50.51 
 
 		 100 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1769  urease subunit gamma  51.52 
 
 		 100 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  54.55 
 
 		 100 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0834  urease subunit gamma  57.73 
 
 		 122 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  51.52 
 
 		 101 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  50.51 
 
 		 100 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0726  urease, beta subunit  49.58 
 
 		 127 aa  105  7e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  51.52 
 
 		 100 aa  105  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03320  urease, gamma subunit  51.52 
 
 		 100 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.968805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  52.53 
 
 		 100 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2355  urease subunit gamma  47.47 
 
 		 100 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  52.53 
 
 		 100 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2312  urease subunit gamma  47.47 
 
 		 100 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.79134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0746  urease, gamma subunit  44.44 
 
 		 108 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0977  urease subunit gamma  51.52 
 
 		 100 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1025  urease, gamma subunit  50.51 
 
 		 100 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3399  urease subunit gamma  51.52 
 
 		 100 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1211  urease, gamma subunit  52.43 
 
 		 103 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1239  urease, gamma subunit  52.53 
 
 		 100 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0282  urease subunit gamma  52.53 
 
 		 100 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113858  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2369  urease subunit gamma  51.52 
 
 		 100 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.437343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>