173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3084 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  100 
 
 		 100 aa  200  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  93 
 
 		 100 aa  186  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  90.91 
 
 		 100 aa  184  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2807  urease subunit gamma  91 
 
 		 100 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00652173  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2851  urease subunit gamma  91 
 
 		 100 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2834  urease subunit gamma  91 
 
 		 100 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  74 
 
 		 100 aa  151  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  72.73 
 
 		 100 aa  150  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5693  urease subunit gamma  74.49 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0834  urease subunit gamma  75.51 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  148  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11876  urease subunit gamma  88.89 
 
 		 100 aa  148  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146779  normal  0.306706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3696  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 100 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1352  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  147  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1729  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  72.73 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 206 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0508  urease, gamma subunit  72.73 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 206 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 206 aa  144  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  70.71 
 
 		 101 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  67.68 
 
 		 100 aa  144  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  70.71 
 
 		 206 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2312  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  144  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.79134  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2355  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  144  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  72.73 
 
 		 100 aa  144  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2454  urease, gamma subunit  70.71 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 206 aa  144  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  70.71 
 
 		 206 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2035  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  144  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.16208  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3504  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  143  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  70 
 
 		 100 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1185  urease, gamma subunit  71.72 
 
 		 100 aa  143  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4008  urease subunit gamma  70 
 
 		 100 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.721691  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1239  urease, gamma subunit  71.72 
 
 		 100 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0423  urease subunit gamma  70 
 
 		 100 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0781  urease subunit gamma  70 
 
 		 100 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0902  urease subunit gamma  70 
 
 		 100 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0872  urease subunit gamma  69 
 
 		 100 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1800  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2271  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  143  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 206 aa  143  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  72.73 
 
 		 100 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3399  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  142  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 100 aa  142  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4240  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  142  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  72.73 
 
 		 100 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  69 
 
 		 100 aa  141  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4185  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 206 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0387  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0977  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0930  urease subunit gamma  68 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  141  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0332  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474292  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1869  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  69 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  69 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3312  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1769  urease subunit gamma  69 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  68 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  69 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  69 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  69 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  69 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  69 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  69 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  67.68 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4411  urease, gamma subunit  66.67 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0268  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  140  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1498  urease subunit gamma  67 
 
 		 100 aa  140  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.791581  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3056  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4837  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164995  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2443  urease, gamma subunit  67 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.972396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  67.68 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3937  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0880  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  138  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2681  urease, gamma subunit  68.69 
 
 		 100 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.399817  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0282  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3664  urease, gamma subunit  64.65 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1429  urease, gamma subunit region  66.67 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1864  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.436059 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2187  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2369  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.437343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2415  urease subunit gamma  76.77 
 
 		 100 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  64.65 
 
 		 100 aa  137  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3464  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  137  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000536162  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1025  urease, gamma subunit  62.63 
 
 		 100 aa  136  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1745  urease, gamma subunit  65.66 
 
 		 100 aa  135  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  0.727576 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0309  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.510674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0746  urease, gamma subunit  61.62 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1211  urease, gamma subunit  65.66 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1954  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1472  urease, gamma subunit  62.63 
 
 		 100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6439  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691822  normal  0.288199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0985  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0725  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>