173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1818 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  100 
 
 		 100 aa  204  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4837  urease subunit gamma  78 
 
 		 100 aa  167  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  79 
 
 		 101 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1472  urease, gamma subunit  78 
 
 		 100 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2454  urease, gamma subunit  74 
 
 		 100 aa  159  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0725  urease, gamma subunit  77.78 
 
 		 100 aa  159  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  74 
 
 		 100 aa  156  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  72 
 
 		 100 aa  155  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  69 
 
 		 100 aa  150  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2271  urease subunit gamma  68 
 
 		 100 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1769  urease subunit gamma  72.73 
 
 		 100 aa  148  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  72.73 
 
 		 100 aa  147  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 100 aa  147  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3399  urease subunit gamma  72.73 
 
 		 100 aa  147  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  66 
 
 		 100 aa  147  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  146  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2443  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 100 aa  146  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.972396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0880  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4008  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.721691  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0423  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0781  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0902  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1025  urease, gamma subunit  67 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0930  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  144  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1498  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  144  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.791581  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0872  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  68 
 
 		 100 aa  144  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0387  urease subunit gamma  65 
 
 		 100 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  71.72 
 
 		 100 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4411  urease, gamma subunit  66 
 
 		 112 aa  143  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3937  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  143  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1864  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  143  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.436059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2187  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  143  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2035  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.16208  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0746  urease, gamma subunit  65.66 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2312  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.79134  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2355  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1239  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03420  urease, gamma subunit  64 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1429  urease, gamma subunit region  67.68 
 
 		 100 aa  141  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1869  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  140  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  66 
 
 		 100 aa  140  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  63 
 
 		 100 aa  140  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1185  urease, gamma subunit  68.69 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0182  urease subunit gamma  66 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64350  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5586  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  68.69 
 
 		 100 aa  138  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1800  urease subunit gamma  63 
 
 		 100 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4432  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.988903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1706  urease, gamma subunit  64 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3504  urease subunit gamma  62 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2681  urease, gamma subunit  66 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.399817  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0977  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1729  urease, gamma subunit  67.68 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4240  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3056  urease subunit gamma  64 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  65 
 
 		 206 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0584  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0988  urease, gamma subunit  64.65 
 
 		 100 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4185  urease subunit gamma  62 
 
 		 100 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  137  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4891  urease, gamma subunit  65.66 
 
 		 100 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2882  urease  65.66 
 
 		 100 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1352  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  136  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3664  urease, gamma subunit  62.63 
 
 		 100 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  65 
 
 		 206 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  65 
 
 		 206 aa  135  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3312  urease subunit gamma  63 
 
 		 100 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  61.62 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2995  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  65 
 
 		 206 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5693  urease subunit gamma  63.92 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0695  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0332  urease subunit gamma  63 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474292  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0268  urease subunit gamma  63 
 
 		 100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09900  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.587773  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0282  urease subunit gamma  63 
 
 		 100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0508  urease, gamma subunit  61.62 
 
 		 100 aa  134  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  63.64 
 
 		 100 aa  134  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  64.65 
 
 		 257 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  134  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0954  urease subunit gamma  63 
 
 		 100 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  62 
 
 		 206 aa  133  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0219  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  133  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.771264 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0834  urease subunit gamma  57 
 
 		 100 aa  133  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3464  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  133  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000536162  normal  0.177811 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>