174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0478 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0478  urease, beta subunit  100 
 
 		 124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.669506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  52.73 
 
 		 108 aa  123  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1768  urease, beta subunit  50.45 
 
 		 102 aa  120  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  50.91 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0835  urease subunit beta  48.18 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  50.45 
 
 		 102 aa  116  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08941  urease subunit beta  46.36 
 
 		 106 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.349786  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2012  urease, beta subunit  49.11 
 
 		 104 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0693  urease subunit beta  49.09 
 
 		 101 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  46.43 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  46.43 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  50.91 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  48.18 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  48.18 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2442  urease, beta subunit  50 
 
 		 101 aa  114  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.549938  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  48.18 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  48.18 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4894  urease, beta subunit  48.18 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  50 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  49.18 
 
 		 206 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  52.21 
 
 		 206 aa  114  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0391  urease, beta subunit  50 
 
 		 117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  48.65 
 
 		 106 aa  113  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  49.55 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  44.72 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  48.18 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.44 
 
 		 231 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4435  urease subunit beta  47.27 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.635744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  48.18 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  48.18 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  50 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0881  urease subunit beta  50 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.590043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  48.18 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0986  urease subunit beta  49.09 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0582515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  50 
 
 		 206 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  48.65 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  50 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1026  urease, beta subunit  47.75 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  48.18 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  46.85 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.11 
 
 		 234 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4223  urease, beta subunit  51.35 
 
 		 102 aa  110  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816788  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2256  urease subunit beta  48.65 
 
 		 106 aa  110  9e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.56 
 
 		 231 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  49.09 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  47.27 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  50.91 
 
 		 206 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  50.46 
 
 		 206 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  46.36 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1308  urease, beta subunit  49.11 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.321935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  49.09 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  50.44 
 
 		 206 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.06 
 
 		 248 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  50 
 
 		 206 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1470  urease, beta subunit  49.11 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  45.54 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2772  urease subunit beta  45.45 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  51.85 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2453  urease, beta subunit  51.02 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  45.95 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  45.95 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  49.56 
 
 		 206 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3938  urease, beta subunit  47.32 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  48.18 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  46.36 
 
 		 101 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  47.27 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  44.55 
 
 		 101 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.67 
 
 		 231 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  44.55 
 
 		 101 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0994  urease subunit beta  46.36 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0688  urease subunit beta  48.18 
 
 		 106 aa  106  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  45.45 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1077  urease subunit beta  43.64 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.18 
 
 		 231 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5588  urease subunit beta  45.45 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2306  urease subunit beta  46.36 
 
 		 108 aa  104  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5113  urease, beta subunit  46.67 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.755356 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  44.55 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0955  urease, beta subunit  45.45 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  46.67 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  46.67 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0220  urease  45.37 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.773173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0242  urease, beta subunit  48.18 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03430  urease, beta subunit  47.27 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  45.28 
 
 		 231 aa  103  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0581  urease subunit beta  44.55 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0386  urease, beta subunit  44.55 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1209  urease, beta subunit  48.18 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6440  urease, beta subunit  41.94 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290036  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1351  urease subunit beta  45.69 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.568363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3465  urease subunit beta  43.24 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00430973  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1183  urease, beta subunit  43.24 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3555  urease subunit beta  48.57 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.417484  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0929  urease, beta subunit  43.64 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1132  urease subunit beta  48.57 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.273178  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64370  urease subunit beta  44.55 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1727  urease, beta subunit  46.3 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3203  urease, beta subunit  46.09 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000313456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4412  Urease  43.55 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1078  urease subunit beta  48.57 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>