176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2714 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2714  Urease  100 
 
 
217 aa  430  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2066  urease, beta subunit  55.56 
 
 
147 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000367697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5113  urease, beta subunit  52.42 
 
 
136 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.755356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1308  urease, beta subunit  52.42 
 
 
136 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.321935  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1470  urease, beta subunit  52.42 
 
 
136 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  57.45 
 
 
164 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  48.82 
 
 
159 aa  124  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  53.85 
 
 
231 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  50.98 
 
 
133 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0688  urease subunit beta  55.21 
 
 
106 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.85 
 
 
231 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0835  urease subunit beta  58.24 
 
 
106 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.25 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.46 
 
 
231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  57.14 
 
 
101 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0726  urease, beta subunit  58.06 
 
 
127 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  55.21 
 
 
112 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64370  urease subunit beta  59.34 
 
 
101 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786003  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  53.76 
 
 
106 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  53.76 
 
 
106 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  59.78 
 
 
106 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  54.26 
 
 
122 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  56.25 
 
 
101 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  57.61 
 
 
101 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0693  urease subunit beta  52.58 
 
 
101 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  54.35 
 
 
113 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  55.43 
 
 
108 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03430  urease, beta subunit  53.12 
 
 
144 aa  112  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08941  urease subunit beta  53.26 
 
 
106 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.349786  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  56.99 
 
 
105 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2453  urease, beta subunit  55.06 
 
 
130 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.84 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  57.61 
 
 
101 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4435  urease subunit beta  54.95 
 
 
101 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.635744  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  54.95 
 
 
101 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1497  urease subunit beta  59.14 
 
 
101 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  58.7 
 
 
101 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1473  urease, beta subunit  49.54 
 
 
126 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  54.84 
 
 
117 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5588  urease subunit beta  57.14 
 
 
101 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0581  urease subunit beta  53.85 
 
 
101 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  57.61 
 
 
101 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  47.42 
 
 
136 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  47.42 
 
 
136 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  54.84 
 
 
105 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  52 
 
 
215 aa  108  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  50.5 
 
 
142 aa  108  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  55.79 
 
 
101 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  54.35 
 
 
231 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3134  urease, beta/gamma subunit  55.79 
 
 
132 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  54.46 
 
 
104 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  58.62 
 
 
231 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0986  urease subunit beta  55.43 
 
 
101 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0582515  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  54.84 
 
 
105 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.26 
 
 
231 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4894  urease, beta subunit  54.95 
 
 
102 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  54.35 
 
 
101 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  54.84 
 
 
101 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  53.85 
 
 
105 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  54.35 
 
 
101 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1768  urease, beta subunit  52.17 
 
 
102 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  55.43 
 
 
101 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0422  urease subunit beta  60 
 
 
101 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0901  urease subunit beta  60 
 
 
101 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1194  urease, beta subunit  47.57 
 
 
112 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.385528  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4836  urease, beta subunit  45.79 
 
 
122 aa  105  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0921761  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2368  urease subunit beta  52.75 
 
 
101 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.569035 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2256  urease subunit beta  53.85 
 
 
106 aa  105  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  49.47 
 
 
101 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0929  urease, beta subunit  56.52 
 
 
101 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  52.27 
 
 
102 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0955  urease, beta subunit  53.19 
 
 
105 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2183  urease subunit beta  56.99 
 
 
101 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  45.71 
 
 
228 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3555  urease subunit beta  46.61 
 
 
158 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.417484  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1132  urease subunit beta  46.61 
 
 
158 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.273178  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0724  urease subunit beta  56.99 
 
 
101 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2558  urease subunit beta  56.99 
 
 
101 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3111  urease subunit beta  56.99 
 
 
101 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2056  urease subunit beta  56.99 
 
 
101 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0994  urease subunit beta  53.26 
 
 
101 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1078  urease subunit beta  46.61 
 
 
144 aa  104  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  52.75 
 
 
106 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  52.17 
 
 
113 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0871  urease subunit beta  58.89 
 
 
101 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3075  urease subunit beta  55.91 
 
 
101 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2489  urease subunit beta  56.67 
 
 
101 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.832851  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3663  urease subunit beta  46.94 
 
 
109 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334015  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1862  urease, beta subunit  55.43 
 
 
101 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779138  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  55.43 
 
 
101 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0780  urease subunit beta  57.78 
 
 
101 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0791  urease subunit beta  57.78 
 
 
101 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0975  urease subunit beta  51.72 
 
 
101 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3693  urease, beta subunit  56.52 
 
 
101 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944796  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  50 
 
 
206 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  53.61 
 
 
104 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1727  urease, beta subunit  51.06 
 
 
101 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  53.68 
 
 
101 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4007  urease subunit beta  57.78 
 
 
101 aa  101  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793578  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  52.27 
 
 
833 aa  101  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>