173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1557 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1557  urease, gamma subunit  100 
 
 
125 aa  254  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08911  urease subunit gamma  62 
 
 
100 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.81237  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08931  urease subunit gamma  61 
 
 
100 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132639  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0323  urease subunit gamma  58 
 
 
100 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000292656  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0332  urease subunit gamma  58 
 
 
100 aa  130  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4837  urease subunit gamma  59 
 
 
100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164995  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0834  urease subunit gamma  59 
 
 
100 aa  127  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.56 
 
 
231 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  58 
 
 
100 aa  127  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  59 
 
 
100 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0725  urease, gamma subunit  59.6 
 
 
100 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  54.03 
 
 
231 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4185  urease subunit gamma  59 
 
 
100 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1800  urease subunit gamma  58 
 
 
100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4411  urease, gamma subunit  58 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2454  urease, gamma subunit  58 
 
 
100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3504  urease subunit gamma  57 
 
 
100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94879  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  59 
 
 
100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19241  urease subunit gamma  59 
 
 
100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.473665  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.22 
 
 
231 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0282  urease subunit gamma  55 
 
 
100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113858  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  57 
 
 
100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  56 
 
 
100 aa  124  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  52.42 
 
 
231 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  57.58 
 
 
100 aa  124  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  52.42 
 
 
231 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  58.59 
 
 
100 aa  124  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0508  urease, gamma subunit  55.56 
 
 
100 aa  124  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0268  urease subunit gamma  55 
 
 
100 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2271  urease subunit gamma  56 
 
 
100 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178249  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1025  urease, gamma subunit  57 
 
 
100 aa  124  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.452528 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1053  urease subunit gamma  58.59 
 
 
100 aa  123  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4008  urease subunit gamma  57.58 
 
 
100 aa  123  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.721691  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0423  urease subunit gamma  57.58 
 
 
100 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0781  urease subunit gamma  57.58 
 
 
100 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0902  urease subunit gamma  57.58 
 
 
100 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  57.58 
 
 
100 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1498  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.791581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1472  urease, gamma subunit  55 
 
 
100 aa  123  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3696  urease, gamma subunit  57 
 
 
100 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0872  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  56.57 
 
 
100 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  57.58 
 
 
100 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4240  urease subunit gamma  59.6 
 
 
100 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  53.47 
 
 
101 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  55.56 
 
 
100 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  56 
 
 
100 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0930  urease subunit gamma  55.56 
 
 
100 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1769  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  121  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0387  urease subunit gamma  53 
 
 
100 aa  120  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03420  urease, gamma subunit  54 
 
 
100 aa  120  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  49.18 
 
 
206 aa  121  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2681  urease, gamma subunit  54 
 
 
100 aa  120  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.399817  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1864  urease subunit gamma  57.58 
 
 
100 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.436059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2187  urease subunit gamma  57.58 
 
 
100 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2443  urease, gamma subunit  56.57 
 
 
100 aa  120  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.972396  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2625  urease subunit gamma  56 
 
 
100 aa  120  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7363  normal  0.529146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0746  urease, gamma subunit  53.54 
 
 
108 aa  120  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2882  urease  54.55 
 
 
100 aa  119  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  47.54 
 
 
206 aa  119  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  119  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  55.56 
 
 
100 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2013  urease, gamma subunit  56 
 
 
100 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2255  urease subunit gamma  55 
 
 
100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0988  urease, gamma subunit  53.54 
 
 
100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1706  urease, gamma subunit  54 
 
 
100 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  50 
 
 
206 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0584  urease subunit gamma  55.56 
 
 
100 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0309  urease subunit gamma  53 
 
 
100 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.510674  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0182  urease subunit gamma  55 
 
 
100 aa  118  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1954  urease subunit gamma  53 
 
 
100 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  50 
 
 
206 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2312  urease subunit gamma  53.54 
 
 
100 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.79134  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2355  urease subunit gamma  53.54 
 
 
100 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1352  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1211  urease, gamma subunit  51 
 
 
103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0977  urease subunit gamma  55.56 
 
 
100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  52.83 
 
 
206 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  55.56 
 
 
100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0985  urease subunit gamma  52 
 
 
100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0695  urease subunit gamma  55.56 
 
 
100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1729  urease, gamma subunit  56.57 
 
 
100 aa  117  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1429  urease, gamma subunit region  54.55 
 
 
100 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  56.57 
 
 
100 aa  117  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3312  urease subunit gamma  52 
 
 
100 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  54.55 
 
 
100 aa  116  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3056  urease subunit gamma  52 
 
 
100 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23215  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1239  urease, gamma subunit  53.54 
 
 
100 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09900  urease subunit gamma  54.55 
 
 
100 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.587773  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64350  urease subunit gamma  55.56 
 
 
100 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5586  urease subunit gamma  55.56 
 
 
100 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>