173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0479 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0479  urease subunit gamma  100 
 
 
101 aa  201  4e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1025  urease, gamma subunit  67.68 
 
 
100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.452528 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0387  urease subunit gamma  65.66 
 
 
100 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  68.69 
 
 
206 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  65.66 
 
 
100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2681  urease, gamma subunit  67.68 
 
 
100 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.399817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  68.69 
 
 
206 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3056  urease subunit gamma  64.65 
 
 
100 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23215  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2369  urease subunit gamma  64.65 
 
 
100 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.437343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  64.65 
 
 
100 aa  130  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0508  urease, gamma subunit  65.66 
 
 
100 aa  130  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  63.64 
 
 
100 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1800  urease subunit gamma  64.65 
 
 
100 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  66.67 
 
 
206 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  68.69 
 
 
206 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1211  urease, gamma subunit  63.64 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0985  urease subunit gamma  63.64 
 
 
100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4185  urease subunit gamma  65.66 
 
 
100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  67.68 
 
 
206 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1745  urease, gamma subunit  62.63 
 
 
100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  0.727576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3504  urease subunit gamma  62.63 
 
 
100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94879  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3312  urease subunit gamma  63.64 
 
 
100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  67.68 
 
 
206 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2013  urease, gamma subunit  69.7 
 
 
100 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  67.68 
 
 
206 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2454  urease, gamma subunit  63.64 
 
 
100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3696  urease, gamma subunit  63.64 
 
 
100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0332  urease subunit gamma  63.64 
 
 
100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474292  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0309  urease subunit gamma  63.64 
 
 
100 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.510674  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1954  urease subunit gamma  63.64 
 
 
100 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  65.66 
 
 
101 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  63.64 
 
 
206 aa  126  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  61.62 
 
 
100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03420  urease, gamma subunit  61.62 
 
 
100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  61.62 
 
 
100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0282  urease subunit gamma  62.63 
 
 
100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113858  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0268  urease subunit gamma  62.63 
 
 
100 aa  125  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  60.61 
 
 
100 aa  124  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2312  urease subunit gamma  58.59 
 
 
100 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.79134  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2355  urease subunit gamma  58.59 
 
 
100 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  60.61 
 
 
100 aa  123  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3664  urease, gamma subunit  59 
 
 
100 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  63.64 
 
 
100 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  61.62 
 
 
100 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  58.59 
 
 
100 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  61.62 
 
 
100 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1706  urease, gamma subunit  64.65 
 
 
100 aa  121  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513247 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3464  urease subunit gamma  61.62 
 
 
100 aa  120  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000536162  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64350  urease subunit gamma  62.63 
 
 
100 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5586  urease subunit gamma  62.63 
 
 
100 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0323  urease subunit gamma  57.58 
 
 
100 aa  120  7e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000292656  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1869  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  120  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1769  urease subunit gamma  63.64 
 
 
100 aa  120  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0834  urease subunit gamma  61.86 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  63.64 
 
 
100 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5693  urease subunit gamma  61.86 
 
 
114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4891  urease, gamma subunit  59.6 
 
 
100 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  62.63 
 
 
100 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.57 
 
 
231 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.57 
 
 
231 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2625  urease subunit gamma  60.61 
 
 
100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7363  normal  0.529146 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0725  urease, gamma subunit  56.57 
 
 
100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.57 
 
 
231 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0695  urease subunit gamma  59.6 
 
 
100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4432  urease subunit gamma  59.6 
 
 
100 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.988903  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  59.6 
 
 
100 aa  117  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.57 
 
 
231 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  60.61 
 
 
100 aa  117  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0954  urease subunit gamma  59.6 
 
 
100 aa  116  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0584  urease subunit gamma  58.59 
 
 
100 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1239  urease, gamma subunit  60.61 
 
 
100 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1352  urease subunit gamma  62.63 
 
 
100 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0880  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  61.62 
 
 
100 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4240  urease subunit gamma  62.63 
 
 
100 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.57 
 
 
215 aa  116  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.57 
 
 
231 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2712  Urease  56.57 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2035  urease subunit gamma  61.62 
 
 
100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.16208  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  61.62 
 
 
100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1729  urease, gamma subunit  59.6 
 
 
100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00887  urease subunit gamma  56.57 
 
 
100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  58.59 
 
 
100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0219  urease subunit gamma  61.62 
 
 
100 aa  114  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.771264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  60.61 
 
 
100 aa  114  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4837  urease subunit gamma  54.55 
 
 
100 aa  114  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164995  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2443  urease, gamma subunit  60.61 
 
 
100 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.972396  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2255  urease subunit gamma  57.58 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  59.6 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1472  urease, gamma subunit  54.55 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  60.61 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1321  urease subunit gamma  62.63 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09900  urease subunit gamma  58.59 
 
 
100 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.587773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3399  urease subunit gamma  60.61 
 
 
100 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0977  urease subunit gamma  60.61 
 
 
100 aa  114  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7012  urease gamma subunit  64.71 
 
 
86 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451916  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2187  urease subunit gamma  59.6 
 
 
100 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0746  urease, gamma subunit  54.55 
 
 
108 aa  114  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2937  urease subunit gamma  64.65 
 
 
100 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2846  urease subunit gamma  64.65 
 
 
100 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>