184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5803 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5803  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  761    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4876  methyltransferase FkbM family  33.79 
 
 		 931 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541495  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1294  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 		 719 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.72 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3512  hypothetical protein  22.81 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2594  hypothetical protein  22.81 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0862  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3062  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 371 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147166  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 		 899 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15390  glycosyltransferase  27.88 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  28.4 
 
 		 419 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 417 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 425 aa  53.1  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.13 
 
 		 935 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 400 aa  52  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1660  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.208349  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  27.59 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2811  glycosyl transferase group 1  22.6 
 
 		 854 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  26.42 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 376 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0909  HepB protein  25.91 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2614  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.91 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.419161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2476  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.91 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4899  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 		 363 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  22.7 
 
 		 415 aa  49.7  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  22.81 
 
 		 358 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 		 408 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 		 408 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 		 408 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  21.62 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  26.64 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.83 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  20.08 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.07 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0545  glycosyl transferase group 1  41.43 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4272  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.553747  normal  0.320513 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  28 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4020  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2813  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  29.61 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 		 354 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 		 354 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 452 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2939  hypothetical protein  24.71 
 
 		 351 aa  47  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  41.67 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 440 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3559  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 380 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23554  normal  0.448657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1983  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.23 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  22.58 
 
 		 413 aa  46.6  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  24.07 
 
 		 471 aa  46.6  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5197  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 		 364 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  28.77 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 		 421 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 		 396 aa  46.2  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  29.58 
 
 		 404 aa  46.2  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  28.49 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  40.28 
 
 		 689 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0361  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0487  glycosyl transferase, group 1  22.7 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>