More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2813 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2813  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
324 aa  671    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2811  glycosyl transferase group 1  53.63 
 
 
854 aa  378  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8126  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  32.85 
 
 
360 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20190  glycosyltransferase  32.45 
 
 
340 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442507  normal  0.152951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0691  glycosyl transferase, group 1  36.89 
 
 
366 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124167  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2855  group 1 glycosyl transferase  32.44 
 
 
364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3692  glycosyl transferase, group 1  36.15 
 
 
361 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2712  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 
370 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  35.67 
 
 
355 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5851  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
364 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2978  putative glycosyltransferase  32.75 
 
 
360 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2085  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
346 aa  165  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2112  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 
373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0862  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
355 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0140  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 
377 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3069  group 1 glycosyl transferase  34.5 
 
 
357 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5555  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
379 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2613  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 
343 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5322  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
376 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
363 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1900  hypothetical protein  32.15 
 
 
351 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744765  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1610  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
377 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.0108296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
359 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3902  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
342 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0911  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 
373 aa  156  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000886615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1204  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
362 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00332154  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5197  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
364 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683568  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1626  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
377 aa  155  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.726366  decreased coverage  0.00120235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1908  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
377 aa  155  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.446815 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0161  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
365 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3151  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
376 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1780  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
354 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3260  glycosyl transferase, group 1  31.66 
 
 
364 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.391924 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  32.46 
 
 
458 aa  152  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4899  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
363 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3461  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
353 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
349 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17290  UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase  31.43 
 
 
360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1141  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 
355 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0760697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
408 aa  145  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
354 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5160  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
336 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
354 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1263  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.88 
 
 
376 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1042  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
339 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
354 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
354 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
354 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
354 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0487  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
355 aa  143  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2980  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
354 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172457  hitchhiker  0.000000269533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
354 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2674  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
367 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.875831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1230  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
374 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.377048  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0142  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
346 aa  142  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224106  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1948  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
355 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.346715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
355 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1363  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 
349 aa  142  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0232549  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2878  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
354 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243297 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.03 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  30.84 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.03 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.03 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
354 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.03 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.03 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4020  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.03 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0199  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2781  putative glycosyl transferase  32.94 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692586  normal  0.55276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 
354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
354 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  31.03 
 
 
354 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 
417 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0361  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
386 aa  140  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.55 
 
 
354 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
354 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
354 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.75 
 
 
354 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  30.84 
 
 
355 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
354 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0250  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
354 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
354 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0702  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
359 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
354 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
354 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>