79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0197 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0197  ferredoxin  100 
 
 
79 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.508683  normal  0.459083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3856  ferredoxin  74.68 
 
 
79 aa  128  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1627  ferredoxin  67.09 
 
 
79 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1654  ferredoxin  67.09 
 
 
79 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0540  ferredoxin  64.56 
 
 
79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3641  ferredoxin  67.09 
 
 
79 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3956  ferredoxin  59.74 
 
 
77 aa  103  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0689877  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2102  NAD-reducing hydrogenase gamma  58.75 
 
 
79 aa  90.5  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.705334  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1597  hypothetical protein  46.84 
 
 
82 aa  68.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.241699  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0772  hypothetical protein  44.3 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16131  hypothetical protein  44.3 
 
 
77 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1260  hypothetical protein  41.25 
 
 
83 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08351  hypothetical protein  44.44 
 
 
81 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12381  hypothetical protein  41.77 
 
 
81 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.156899  normal  0.010521 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0765  hypothetical protein  40.51 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.11271 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13381  hypothetical protein  37.18 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13281  hypothetical protein  33.75 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13531  hypothetical protein  35.44 
 
 
84 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.430148  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3358  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.74 
 
 
354 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  43.14 
 
 
357 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  45.1 
 
 
360 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.74 
 
 
354 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  43.14 
 
 
760 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.48 
 
 
353 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.11 
 
 
374 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  40 
 
 
376 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.71 
 
 
917 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1326  oxidoreductase FAD-binding region  38.89 
 
 
354 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49401  predicted protein  34.85 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  40 
 
 
376 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  44 
 
 
381 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  40 
 
 
366 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  37.1 
 
 
356 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  37.04 
 
 
353 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  40.38 
 
 
622 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  42 
 
 
363 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46 
 
 
363 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.33 
 
 
349 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  41.18 
 
 
638 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.67 
 
 
349 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3559  p-cymene monooxygenase, reductase subunit(CymAb)  33.33 
 
 
349 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393821  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3111  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.04 
 
 
351 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  43.4 
 
 
630 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  45.28 
 
 
585 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42 
 
 
381 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.67 
 
 
349 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  47.06 
 
 
350 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0730  [Fe] hydrogenase, HymC subunit, putative  36.92 
 
 
222 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.793468  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  33.82 
 
 
783 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2966  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.62 
 
 
354 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0998683  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  38 
 
 
376 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  31.82 
 
 
247 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  33.82 
 
 
783 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  36.54 
 
 
93 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47390  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.46 
 
 
322 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  40 
 
 
385 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.21 
 
 
414 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.14 
 
 
341 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2902  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 
349 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.612031 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  48.48 
 
 
375 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5112  ferredoxin  42 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528807  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  35.29 
 
 
360 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  35.29 
 
 
360 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  38 
 
 
380 aa  40.8  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  46.67 
 
 
353 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.48 
 
 
354 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.48 
 
 
354 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1523  ferredoxin  35.82 
 
 
236 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171825  hitchhiker  0.00403982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  40 
 
 
372 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  47.73 
 
 
350 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.48 
 
 
354 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4115  hydrogen dehydrogenase  36.62 
 
 
239 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.335137 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  40.74 
 
 
351 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.19 
 
 
332 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1593  putative ferredoxin NAD(+) reductase  38.89 
 
 
332 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  40.91 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2100  ferredoxin  33.8 
 
 
609 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.624892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0303  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.55 
 
 
322 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38 
 
 
366 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>