37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0540 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0540  ferredoxin  100 
 
 
79 aa  160  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0197  ferredoxin  64.56 
 
 
79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.508683  normal  0.459083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1654  ferredoxin  56.96 
 
 
79 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1627  ferredoxin  56.96 
 
 
79 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3641  ferredoxin  62.03 
 
 
79 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3856  ferredoxin  60 
 
 
79 aa  98.2  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40418  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3956  ferredoxin  56 
 
 
77 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0689877  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2102  NAD-reducing hydrogenase gamma  53.09 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.705334  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0765  hypothetical protein  40 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.11271 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1597  hypothetical protein  43.04 
 
 
82 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.241699  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13281  hypothetical protein  39.73 
 
 
81 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1260  hypothetical protein  41.33 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13381  hypothetical protein  43.08 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0772  hypothetical protein  41.03 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16131  hypothetical protein  41.03 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12381  hypothetical protein  41.03 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.156899  normal  0.010521 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08351  hypothetical protein  48.39 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13531  hypothetical protein  35.62 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.430148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  48.15 
 
 
638 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  44.9 
 
 
350 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  44.9 
 
 
350 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1593  putative ferredoxin NAD(+) reductase  44.9 
 
 
332 aa  43.9  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  44.9 
 
 
357 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.62 
 
 
346 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49401  predicted protein  38.89 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476648  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.62 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.62 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.62 
 
 
349 aa  42  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.51 
 
 
917 aa  41.2  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3208  Pdr/VanB family oxidoreductase  50 
 
 
314 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  44.23 
 
 
357 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1326  oxidoreductase FAD-binding region  36.73 
 
 
354 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3559  p-cymene monooxygenase, reductase subunit(CymAb)  34.78 
 
 
349 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393821  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0730  [Fe] hydrogenase, HymC subunit, putative  35.59 
 
 
222 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.793468  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.91 
 
 
350 aa  40  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  44.23 
 
 
360 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_636  [Fe] hydrogenase, HymC subunit  35.59 
 
 
240 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.452884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>