22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49401 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49401  predicted protein  100 
 
 
140 aa  283  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476648  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46444  electron carrier protein  29.85 
 
 
235 aa  47  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12381  hypothetical protein  40 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.156899  normal  0.010521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0197  ferredoxin  34.85 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.508683  normal  0.459083 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.11 
 
 
1004 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1983  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.76 
 
 
912 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.103062  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3956  ferredoxin  36.36 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0689877  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1597  hypothetical protein  35.42 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.241699  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3856  ferredoxin  36.36 
 
 
79 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0540  ferredoxin  38.89 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0765  hypothetical protein  35.42 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.11271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3149  ferredoxin  48.57 
 
 
154 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1211  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.07 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.103278  normal  0.545927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1247  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  40 
 
 
914 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.265389  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39700  Ferredoxin  42.37 
 
 
122 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13381  hypothetical protein  30.19 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3871  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.48 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1627  ferredoxin  31.82 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1763  (2Fe-2S)-binding  35.21 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.102431  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1654  ferredoxin  31.82 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2695  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  41.82 
 
 
903 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.980449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2750  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.88 
 
 
240 aa  40  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>