34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39700 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_39700  Ferredoxin  100 
 
 		 122 aa  252  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3149  ferredoxin  54.17 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0232  ferredoxin, 2Fe-2S  55.83 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1188  ferredoxin  57.02 
 
 		 124 aa  140  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000641343 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2499  ferredoxin  54.92 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.809791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1751  putative 2Fe-2S ferredoxin protein  51.64 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  51.69 
 
 		 302 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0397  ferredoxin  51.64 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.449026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  50.85 
 
 		 302 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  50 
 
 		 301 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  50 
 
 		 301 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1916  ferredoxin  48.33 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2342  ferredoxin  47.83 
 
 		 115 aa  116  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3778  ferredoxin  41.8 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1237  ferredoxin  46.09 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0193309 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1519  ferredoxin  46.09 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0937354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0287  ferredoxin  40.98 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1449  ferredoxin  48.31 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0545  ferredoxin  40.17 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1236  ferredoxin  30.17 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0203128 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1518  ferredoxin, putative  30.17 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0846747  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  42 
 
 		 350 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  47.92 
 
 		 769 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  37.1 
 
 		 662 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49401  predicted protein  42.37 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  46.34 
 
 		 357 aa  41.2  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.91 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  30.91 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.91 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.91 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  30.91 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.21 
 
 		 350 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.21 
 
 		 350 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.58 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>