193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_R0059 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_R0057  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0059  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234282  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21440  tRNA-Tyr  95.12 
 
 		 82 bp  131  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000199792  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0046  tRNA-Tyr  98.55 
 
 		 82 bp  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0016  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.972544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17640  tRNA-Tyr  97.96 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  90.62 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  90.32 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07640  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  0.0415819 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0010  tRNA-Tyr  90.91 
 
 		 83 bp  75.8  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00640732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0002  tRNA-Tyr  89.71 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03440  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0051  tRNA-Tyr  87.06 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0652874  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0014  tRNA-Tyr  93.18 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526877  normal  0.0596738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0027  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.645758  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0010  tRNA-Tyr  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367926  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0001  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0043  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0206397  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt06  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt10  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.882625 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna4  tRNA-Tyr  87.69 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0015  tRNA-Tyr  87.69 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000666826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0007  tRNA-Tyr  86.89 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000157532  hitchhiker  0.000000000121254 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0021  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0050  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00161887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0029  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0029  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572111  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0022  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322461  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0007  tRNA-Tyr  91.3 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0265739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  87.72 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0008  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0045  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011189  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0053  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0013  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 81 bp  50.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167432  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0054  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000756603  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0007  tRNA-Tyr  85.25 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312079  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0054  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000219013  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00025  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.413695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00026  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593643  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00075  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000048411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0050  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00114696  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0093  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000017829  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1890  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.710503  normal  0.374202 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0042  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4352  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000588121  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4663  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.25071e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0090  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00740419 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1884  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1568  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1387  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0734169  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4549  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000359327  hitchhiker  0.00000000000121072 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0108  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000394419  hitchhiker  0.00222111 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2436  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2438  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTyr01  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618223  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0063  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0046  tRNA-Tyr  90 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1947  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1949  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0009  tRNA-Tyr  84.72 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNATyrVIMSS1309201  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0854141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1892  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.729122  normal  0.381192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1570  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0021  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000055523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0065  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135481  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4384  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000011593  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1385  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321672  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1714  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0409502  normal  0.981337 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0023  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0004  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000458141  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0047  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0048  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0058  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4425  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181979  hitchhiker  0.0000468307 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4232  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1910  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178107  normal  0.179459 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4471  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000736073  hitchhiker  0.00060065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4665  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00193221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4666  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000338441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4718  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.22023e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5031  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0188651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5032  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5101  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000185347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0012  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000806893  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0064  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  0.000177122 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0065  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695286  hitchhiker  0.000177122 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0021  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000249749  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1886  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0997724 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2336  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000102833  normal  0.0356366 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2800  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000115343  normal  0.0987715 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>