119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0002 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_R0002  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt06  tRNA-Tyr  91.03 
 
 		 86 bp  99.6  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt10  tRNA-Tyr  90.79 
 
 		 83 bp  95.6  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.882625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0046  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 82 bp  79.8  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0010  tRNA-Tyr  89.55 
 
 		 83 bp  77.8  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00640732  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0019  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 83 bp  75.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00432304  decreased coverage  0.00738157 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  90.77 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0059  tRNA-Tyr  89.71 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234282  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  90 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  90 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0057  tRNA-Tyr  89.71 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0037  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000333812  normal  0.463641 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0077  tRNA-Tyr  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0045  tRNA-Tyr  85.37 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0048  tRNA-Tyr  95.24 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0022  tRNA-Tyr  84.88 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0256241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05585  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000486194  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000509746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0058  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0117646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3797  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000392981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0020  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3087  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000100368  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0079  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0059  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0061  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000782814  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0043  tRNA-Tyr  89.29 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0206397  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0012  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000828702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0011  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000000561505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3189  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000533959  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0068  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.544581  normal  0.0861147 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1903  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000431131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3765  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3827  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3458  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000255407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0009  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000816684  normal  0.0119926 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0012  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122749  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0058  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0012  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000498022  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  88.24 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0072  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172192  normal  0.224883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0059  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111463  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0050  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna4  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0015  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000666826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0053  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  85.54 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0068  tRNA-Tyr  89.83 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0060  tRNA-Tyr  97.06 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0006  tRNA-Tyr  91.11 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0006  tRNA-Tyr  91.11 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0005  tRNA-Tyr  91.11 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.1889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0005  tRNA-Tyr  91.11 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.998784  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0042  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0021  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0050  tRNA-Tyr  86.67 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00161887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0038  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.105251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0060  tRNA-Tyr  86.67 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000231954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0057  tRNA-Tyr  86.67 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.658819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNATyrVIMSS1309201  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0854141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0022  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322461  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0003  tRNA-Tyr  86.67 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0010  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367926  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0036  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45022  normal  0.113165 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0054  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000219013  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0054  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000756603  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0029  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0029  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0029  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572111  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0063  tRNA-Tyr  86.67 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0045  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000472337  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0056  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00201285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0035  tRNA-Tyr  97.14 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0046  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 86 bp  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000858289  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0028  tRNA-Tyr  96.67 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0846245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0021  tRNA-Tyr  96.67 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0007  tRNA-Tyr  96.67 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0265739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0009  tRNA-Tyr  96.67 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0022  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0313146  normal  0.1141 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0015  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0009  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATyrVIMSS1309080  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATyrVIMSS1309112  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.722386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNATyrVIMSS1309298  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0675624 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATyrVIMSS1309156  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0055  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0009  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNATyrVIMSS1309353  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  85.96 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  85.96 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0033  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0017  tRNA-Tyr  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0042  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.755335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0025  tRNA-Tyr  85 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.578313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  86.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0054  tRNA-Tyr  86.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0037  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.216376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>