More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0010 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0010  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367926  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  97.7 
 
 		 87 bp  157  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  93.85 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0037  tRNA-Tyr  88.46 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0466069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  88.46 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0023  tRNA-Tyr  91.04 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  91.04 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  95.56 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00075  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000048411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0093  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000017829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4718  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.22023e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4663  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.25071e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0108  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000394419  hitchhiker  0.00222111 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0043  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4471  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000736073  hitchhiker  0.00060065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0064  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  0.000177122 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5101  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000185347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4549  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000359327  hitchhiker  0.00000000000121072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0083  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000525158  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0052  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.573549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5442  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000118281  hitchhiker  0.000431346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0090  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000426682  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4384  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000011593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0012  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000806893  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4352  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000588121  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0065  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695286  hitchhiker  0.000177122 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4474  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000330783  hitchhiker  0.00000000000000918445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0044  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0006  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000152746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0004  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000458141  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4425  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181979  hitchhiker  0.0000468307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0054  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0006  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220808  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0013  tRNA-Tyr  87.36 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0047  tRNA-Tyr  88 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  95.35 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0012  tRNA-Tyr  88.41 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17640  tRNA-Tyr  89.06 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00025  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.413695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00026  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0049  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00226201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0050  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00114696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1446  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0058  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2800  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000115343  normal  0.0987715 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1387  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0734169  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1884  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0005  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.434844  hitchhiker  0.00676871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1911  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0172015  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1890  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.710503  normal  0.374202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0057  tRNA-Tyr  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1910  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178107  normal  0.179459 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0056  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133037 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0006  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000863158  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4666  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000338441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1716  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220424  normal  0.977011 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5031  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0188651  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4665  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00193221  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1949  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0021  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173415  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1570  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTyr01  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0013  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0020  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.230904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0059  tRNA-Tyr  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234282  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1892  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.729122  normal  0.381192 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4288  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0048  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0047  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1568  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5032  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306816  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1947  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1886  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0997724 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2336  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000102833  normal  0.0356366 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1714  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0409502  normal  0.981337 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4232  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4231  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011802  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1385  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  87.32 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0021  tRNA-Tyr  97.44 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  87.32 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0001  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232487  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0015  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2436  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2438  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2441  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2146  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2148  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2151  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna127  tRNA-Tyr  85.9 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000596133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna049  tRNA-Tyr  85.9 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000729989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna126  tRNA-Tyr  85.9 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0028  tRNA-Tyr  97.44 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0846245 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATyrVIMSS1309080  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATyrVIMSS1309112  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.722386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0009  tRNA-Tyr  97.44 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATyrVIMSS1309156  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>