46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0047 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0047  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0049  tRNA-Tyr  89.71 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0014  tRNA-Tyr  89.71 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  88 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0010  tRNA-Tyr  88 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367926  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  86.67 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  85.14 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0060  tRNA-Tyr  86.15 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  86.76 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0012  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000201631  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0047  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0011  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0065  tRNA-Tyr  86.36 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0086  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000985673  normal  0.992402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0017  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0316061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0012  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0008  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt06  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t05  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 81 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000929423  unclonable  0.000000191468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0014  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000673515  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  85.29 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  83.82 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  85.29 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0036  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2151  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2436  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0038  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2438  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2441  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt10  tRNA-Tyr  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.882625 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2146  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2148  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05585  tRNA-Tyr  82.43 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000486194  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0028  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000249872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0058  tRNA-Tyr  82.43 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0117646  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0053  tRNA-Tyr  82.43 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0045  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000472337  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0022  tRNA-Tyr  82.86 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0256241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0022  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4432900000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0059  tRNA-Tyr  82.43 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna28  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.751931  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0050  tRNA-Tyr  82.43 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0023  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0238179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0002  tRNA-Tyr  82.86 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0056  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00201285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>