147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0022 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0022  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0256241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0045  tRNA-Tyr  89.66 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000472337  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0056  tRNA-Tyr  89.66 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00201285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  86.59 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0002  tRNA-Tyr  84.88 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0006  tRNA-Tyr  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0005  tRNA-Tyr  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.1889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0005  tRNA-Tyr  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.998784  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0042  tRNA-Met  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.873086  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0068  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  86.15 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0077  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000407125  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0011  tRNA-Tyr  85.25 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0058  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0077  tRNA-Tyr  84.72 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0062  tRNA-Met  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0374221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0001  tRNA-Met  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0065  tRNA-Met  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0018  tRNA-Met  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.69443  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0006  tRNA-Met  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0343832 
 
 
-
 
NC_002950  PGt06  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt10  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.882625 
 
 
-
 
NC_006368  lppt16  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt16  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131801 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1539  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1595  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957281  normal  0.565179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0012  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000365391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0037  tRNA-Tyr  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000333812  normal  0.463641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00017  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000192994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00019  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000148305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00020  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000893076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000923528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000150882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0031  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0054  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153086  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0055  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0056  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000193092  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0060  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.42893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0020  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929177  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0070  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000571368  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0009  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0079  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0036  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000225732  normal  0.109866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0038  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000184687  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0040  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351036  normal  0.107458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0064  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000662129  normal  0.0840838 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0046  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0029  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00945673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4655  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  8.59319e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4657  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.396889999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4660  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.11514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4661  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4684  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.3682299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5020  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5022  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000229653  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5023  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5024  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192703  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5052  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0051  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000190999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0052  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683016  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0053  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000900565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0010  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367926  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0046  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000858289  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0068  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000208772  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0069  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000622929  normal  0.276829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0766  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000107183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0768  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000959618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0770  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0771  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0772  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2557  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000373976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0583  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.0474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0593  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.55159e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0666  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000300232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0667  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201635  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2783  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.45376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna4  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0015  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000666826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0814  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000653999  normal  0.868526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0816  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000928863  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0817  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000862266  normal  0.885127 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0818  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0005423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0819  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  normal  0.860753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2611  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000669523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0878  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000133144  normal  0.655098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0880  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000131793  normal  0.645347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0882  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000105642  normal  0.563094 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2677  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0910  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000110195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0912  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000796391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0913  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000921732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>