108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_R0068 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_R0068  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0015  tRNA-Tyr  92.16 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATyrVIMSS1309080  tRNA-Tyr  92.16 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATyrVIMSS1309112  tRNA-Tyr  92.16 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.722386  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATyrVIMSS1309156  tRNA-Tyr  92.16 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  91.53 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0022  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0313146  normal  0.1141 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNATyrVIMSS1309298  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0675624 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNATyrVIMSS1309353  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0016  tRNA-Tyr  90.2 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0163881 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0002  tRNA-Tyr  89.83 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  89.83 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0017  tRNA-Tyr  90.2 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411262  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4565  tRNA-Tyr  90.2 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795414  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0016  tRNA-Tyr  90.2 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0065  tRNA-Tyr  87.93 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  87.93 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0042  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNATyrVIMSS1309201  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0854141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0010  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0028  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0846245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0021  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0007  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0265739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0009  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  87.27 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0012  tRNA-Tyr  87.27 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787862  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0036  tRNA-Tyr  88.24 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0046  tRNA-Tyr  85.07 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0054  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0008  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0022  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0256241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0070  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0063  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0012  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000201631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0038  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481051  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0045  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0077  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0030  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105228  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0090  tRNA-Tyr  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00740419 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0038  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.105251 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0027  tRNA-Tyr  84.38 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.645758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0029  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0033  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0002  tRNA-Tyr  86.54 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0003  tRNA-Tyr  86.54 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0050  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563652  normal  0.998749 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0036  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45022  normal  0.113165 
 
 
-
 
NC_003295  RS05585  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000486194  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t23  tRNA-Tyr  86.27 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000509746  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3797  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000392981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0020  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3087  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000100368  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0014  tRNA-Tyr  85.45 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0079  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0061  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000782814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2436  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2438  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2441  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2146  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2148  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2151  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTyr01  tRNA-Tyr  85.45 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618223  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0012  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000828702  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0059  tRNA-Tyr  85.45 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0011  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000000561505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3189  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000533959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1903  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000431131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0021  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000055523  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3765  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3827  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3458  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000255407  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0434  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0435  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0436  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2720  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000267596  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1215  tRNA-Tyr  86.27 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0034  tRNA-Tyr  86.27 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0049  tRNA-Tyr  85.45 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0008  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0021  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000249749  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0009  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000816684  normal  0.0119926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0054  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0007  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.737709 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0012  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122749  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0012  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000498022  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0072  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172192  normal  0.224883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0059  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111463  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0056  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467889  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0058  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0035  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0057  tRNA-Tyr  85.45 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012008 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0044  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0053  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798877 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>