64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_R0011 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_R0011  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0008  tRNA-Tyr  95.35 
 
 		 85 bp  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0009  tRNA-Tyr  91.57 
 
 		 83 bp  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0055  tRNA-Tyr  90.7 
 
 		 86 bp  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0006  tRNA-Tyr  90.59 
 
 		 86 bp  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0005  tRNA-Tyr  90.59 
 
 		 86 bp  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.1889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0005  tRNA-Tyr  90.59 
 
 		 86 bp  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.998784  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21340  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 86 bp  99.6  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0704715  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0070  tRNA-Tyr  91.46 
 
 		 85 bp  99.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0008  tRNA-Tyr  90.7 
 
 		 85 bp  99.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0014  tRNA-Tyr  97.92 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0049  tRNA-Tyr  97.92 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14005  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 84 bp  83.8  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.844659 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0006  tRNA-Tyr  87.67 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0065  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0649781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0012  tRNA-Tyr  97.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0013  tRNA-Tyr  93.48 
 
 		 81 bp  67.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167432  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0054  tRNA-Tyr  88.41 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0012  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0016  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.972544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0053  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0051  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0652874  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0008  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323474  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0074  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727456  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0010  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0047  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0043  tRNA-Tyr  84.85 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0206397  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0010  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0050  tRNA-Tyr  84.62 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00161887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  84.62 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0010  tRNA-Tyr  84.62 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00640732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0022  tRNA-Tyr  85.25 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0256241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0012  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787862  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0047  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  85.94 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0057  tRNA-Tyr  84.38 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.343924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0014  tRNA-Tyr  89.74 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526877  normal  0.0596738 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna126  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01441  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0006  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000157538  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01442  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0033  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90982  normal  0.487146 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01443  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0434  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0435  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000139864  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0008  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0436  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna128  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000522671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna127  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000596133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3207t  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0563071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna049  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000729989  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0437  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000091753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0031  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.219663 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2720  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000267596  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00236  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0047  tRNA-Tyr  84.85 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01440  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3167t  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000658084  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3168t  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3169t  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000963537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>