120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_R0012 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_R0012  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0014  tRNA-Tyr  89.55 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0049  tRNA-Tyr  89.55 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0008  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0011  tRNA-Tyr  97.37 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0008  tRNA-Tyr  90.38 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0070  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0036  tRNA-Tyr  84.85 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45022  normal  0.113165 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0038  tRNA-Tyr  84.85 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.105251 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17640  tRNA-Tyr  84.85 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193498  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0434  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0435  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0436  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2720  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000267596  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  86.36 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  86.36 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0029  tRNA-Tyr  84.85 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0015  tRNA-Tyr  84.62 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0042  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.755335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0015  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.914639  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATyrVIMSS1309080  tRNA-Tyr  84.62 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATyrVIMSS1309112  tRNA-Tyr  84.62 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.722386  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATyrVIMSS1309156  tRNA-Tyr  84.62 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0047  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0060  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000231954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0057  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.658819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0025  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.578313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0055  tRNA-Tyr  84.72 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0012  tRNA-Tyr  83.33 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787862  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0063  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0003  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0040  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4783  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0161693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03440  tRNA-Tyr  83.1 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0054  tRNA-Tyr  83.1 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0035  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t006  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t045  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t046  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t047  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0014  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.64782e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0008  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000321728  hitchhiker  0.00000918644 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0005  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002791  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0074  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.700319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0075  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0013  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000242624  normal  0.0244003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0095  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000654361  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0096  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00070521  normal  0.980641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0097  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186117  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0093  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00406786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0094  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000412805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0095  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000439573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0010  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0067  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.439921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0068  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.314206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0069  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08650  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000227775  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0093  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000411147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0094  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0011  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000044302  hitchhiker  0.000585411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0071  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0977282  normal  0.857098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0072  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0964412  normal  0.850187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0012  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000365391  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t05  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t06  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0048  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0049  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0050  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.399527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0132  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000516023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0007  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171771  normal  0.0302346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0071  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.676805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0072  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.926918 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0073  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.92183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0054  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.329016  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0055  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0056  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0819  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0012  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000467845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0058  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.17611  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1874  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0618202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0014  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000039467  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0113  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.532695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0114  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.524989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0115  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.542258  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0116  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.427011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0117  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.439512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0014  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000873726  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0066  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.119149  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0067  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11453  normal  0.549704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0068  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112006  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0069  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.548705  normal  0.0555108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0070  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.531794  normal  0.0573662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0071  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719638  normal  0.0567471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0072  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554165  normal  0.0570473 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>