130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_tRNATyrVIMSS1309080 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_R0015  tRNA-Tyr  100 
 
 
82 bp  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATyrVIMSS1309080  tRNA-Tyr  100 
 
 
82 bp  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATyrVIMSS1309112  tRNA-Tyr  100 
 
 
82 bp  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.722386  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATyrVIMSS1309156  tRNA-Tyr  100 
 
 
82 bp  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0022  tRNA-Tyr  98.78 
 
 
82 bp  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0313146  normal  0.1141 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNATyrVIMSS1309298  tRNA-Tyr  98.78 
 
 
85 bp  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0675624 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNATyrVIMSS1309353  tRNA-Tyr  98.78 
 
 
85 bp  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0042  tRNA-Tyr  96.34 
 
 
82 bp  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0030  tRNA-Tyr  96.34 
 
 
85 bp  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105228  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNATyrVIMSS1309201  tRNA-Tyr  96.34 
 
 
82 bp  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0854141  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0036  tRNA-Tyr  97.18 
 
 
85 bp  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0033  tRNA-Tyr  92.68 
 
 
85 bp  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t23  tRNA-Tyr  95.52 
 
 
82 bp  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0016  tRNA-Tyr  95.52 
 
 
85 bp  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1215  tRNA-Tyr  95.52 
 
 
87 bp  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0016  tRNA-Tyr  95.52 
 
 
85 bp  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0163881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0034  tRNA-Tyr  95.52 
 
 
85 bp  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4565  tRNA-Tyr  95.52 
 
 
85 bp  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795414  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0017  tRNA-Tyr  95.52 
 
 
85 bp  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411262  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0038  tRNA-Tyr  91.46 
 
 
82 bp  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.105251 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0036  tRNA-Tyr  91.46 
 
 
85 bp  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45022  normal  0.113165 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0029  tRNA-Tyr  91.46 
 
 
85 bp  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  92.96 
 
 
85 bp  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0035  tRNA-Tyr  90.24 
 
 
82 bp  99.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  93.06 
 
 
86 bp  95.6  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  93.06 
 
 
86 bp  95.6  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0560  tRNA-Tyr  91.55 
 
 
84 bp  85.7  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000480165  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0042  tRNA-Tyr  87.8 
 
 
85 bp  83.8  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.755335  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS05585  tRNA-Tyr  88.89 
 
 
86 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000486194  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0053  tRNA-Tyr  88.89 
 
 
86 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0050  tRNA-Tyr  88.89 
 
 
86 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160697  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0046  tRNA-Tyr  86.75 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000858289  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000509746  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3797  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000392981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0020  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
83 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230184  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3087  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000100368  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0079  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287408  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0061  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000782814  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0015  tRNA-Tyr  88.06 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.914639  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0012  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000828702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0011  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000000561505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3189  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000533959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1903  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000431131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3765  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3827  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3458  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000255407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  95.35 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  95.35 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  95.35 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0009  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000816684  normal  0.0119926 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  95.35 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0012  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122749  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0012  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000498022  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0072  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172192  normal  0.224883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0059  tRNA-Tyr  88.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111463  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0068  tRNA-Tyr  92.16 
 
 
82 bp  69.9  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0009  tRNA-Tyr  93.33 
 
 
83 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0028  tRNA-Tyr  93.33 
 
 
83 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0846245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0021  tRNA-Tyr  93.33 
 
 
83 bp  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0002  tRNA-Tyr  87.5 
 
 
86 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0003  tRNA-Tyr  87.5 
 
 
86 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0060  tRNA-Tyr  85.54 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00028228  normal  0.398472 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0010  tRNA-Tyr  93.02 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0046  tRNA-Tyr  86.89 
 
 
82 bp  58  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09740  tRNA-Tyr  86.15 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000000943193  hitchhiker  0.0000123318 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0047  tRNA-Tyr  86.15 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0007  tRNA-Tyr  100 
 
 
83 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0265739 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0063  tRNA-Tyr  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0058  tRNA-Tyr  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0117646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0090  tRNA-Tyr  88.46 
 
 
86 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00740419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0050  tRNA-Tyr  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00161887  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0059  tRNA-Tyr  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0060  tRNA-Tyr  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000231954  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0057  tRNA-Tyr  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.658819  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0025  tRNA-Tyr  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.578313  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0068  tRNA-Tyr  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.544581  normal  0.0861147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0003  tRNA-Tyr  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0058  tRNA-Tyr  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0065  tRNA-Tyr  85.71 
 
 
85 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135481  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0007  tRNA-Tyr  84.51 
 
 
85 bp  54  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312079  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0731  tRNA-Tyr  85.71 
 
 
87 bp  54  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0014  tRNA-Tyr  92.11 
 
 
85 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000194257  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0010  tRNA-Tyr  85.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000639751  normal  0.164042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0054  tRNA-Tyr  100 
 
 
82 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0007  tRNA-Tyr  100 
 
 
82 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.737709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0056  tRNA-Tyr  100 
 
 
82 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467889  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0058  tRNA-Tyr  100 
 
 
82 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08620  tRNA-Tyr  93.94 
 
 
84 bp  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000490301  hitchhiker  0.0000012455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0012  tRNA-Tyr  84.62 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787862  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0002  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0073  tRNA-Tyr  88.89 
 
 
86 bp  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665729  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0022  tRNA-Tyr  90.24 
 
 
84 bp  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4432900000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0012  tRNA-Tyr  84.62 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0058  tRNA-Tyr  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0015  tRNA-Tyr  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216156  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17640  tRNA-Tyr  86.54 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0035  tRNA-Tyr  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283862  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  90 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0008  tRNA-Tyr  85 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>