More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_R0037 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_R0037  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0466069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0018  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00106012  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt04  tRNA-Tyr  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt04  tRNA-Tyr  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0010  tRNA-Tyr  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.29414e-23  normal  0.0775658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0005  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 85 bp  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.434844  hitchhiker  0.00676871 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0308  tRNA-Tyr  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.0000522223  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0004  tRNA-Tyr  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000291052  hitchhiker  0.00000658966 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna128  tRNA-Tyr  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000522671  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0044  tRNA-Tyr  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000011625  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna127  tRNA-Tyr  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000596133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna049  tRNA-Tyr  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000729989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0010  tRNA-Tyr  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000639751  normal  0.164042 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna126  tRNA-Tyr  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01441  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 82 bp  99.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01440  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 82 bp  99.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00236  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 82 bp  99.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0063  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 85 bp  99.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01442  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 82 bp  99.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0023  tRNA-Tyr  90.7 
 
 		 86 bp  99.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  90.7 
 
 		 86 bp  99.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01443  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 82 bp  99.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0014  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000873726  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0115  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.542258  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0066  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.119149  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0117  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.439512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0116  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.427011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t006  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t045  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t046  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t047  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0070  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.531794  normal  0.0573662 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0126  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000000986876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0071  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719638  normal  0.0567471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0056  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0055  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337665  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0050  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.399527  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0114  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.524989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0014  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000039467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0073  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.92183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0057  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172076  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0049  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0069  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0072  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.926918 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0005  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002791  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0074  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.700319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0075  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0076  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0048  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t06  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0044  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0054  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.329016  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0132  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000516023  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0058  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.17611  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0012  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000467845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0056  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153406  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTyr01  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 88 bp  97.6  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618223  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0013  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000242624  normal  0.0244003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0095  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000654361  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0096  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00070521  normal  0.980641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0097  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186117  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0013  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000911406  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0093  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00406786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0094  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000412805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0095  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000439573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0010  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0067  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.439921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0068  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.314206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0069  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0071  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.676805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0007  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171771  normal  0.0302346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0060  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.500822  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0013  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000166479  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0092  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000450413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0093  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000411147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0094  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0113  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.532695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0011  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000044302  hitchhiker  0.000585411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0070  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157981  normal  0.850187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0071  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0977282  normal  0.857098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0072  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0964412  normal  0.850187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0072  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554165  normal  0.0570473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0155  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720201  hitchhiker  0.000109312 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0069  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.548705  normal  0.0555108 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0027  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.645758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0067  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11453  normal  0.549704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0068  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112006  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0065  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135481  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t04  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t05  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t077  tRNA-Tyr  89.29 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00521394  normal  0.158484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t076  tRNA-Tyr  89.29 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00524716  normal  0.153954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t074  tRNA-Tyr  89.29 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00586158  normal  0.155604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t006  tRNA-Tyr  89.29 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000887423  normal  0.123776 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0093  tRNA-Tyr  89.02 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000017829  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4352  tRNA-Tyr  89.02 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000588121  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4474  tRNA-Tyr  89.02 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000330783  hitchhiker  0.00000000000000918445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4471  tRNA-Tyr  89.02 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000736073  hitchhiker  0.00060065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>