More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0051 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  98.86 
 
 		 88 bp  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  95.71 
 
 		 85 bp  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 87 bp  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0027  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 85 bp  99.6  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.645758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0033  tRNA-Tyr  92.96 
 
 		 85 bp  93.7  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90982  normal  0.487146 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  91.55 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0050  tRNA-Tyr  93.65 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563652  normal  0.998749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0037  tRNA-Tyr  90.14 
 
 		 86 bp  85.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000333812  normal  0.463641 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0047  tRNA-Tyr  88.73 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0045  tRNA-Tyr  88.73 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0090  tRNA-Tyr  90.14 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00740419 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0057  tRNA-Tyr  88.73 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.343924  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna4  tRNA-Tyr  88.57 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0015  tRNA-Tyr  88.57 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000666826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  86.36 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0043  tRNA-Tyr  90 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0206397  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0060  tRNA-Tyr  87.32 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0021  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  94 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0022  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322461  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0008  tRNA-Tyr  88.73 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0029  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0029  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572111  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0044  tRNA-Tyr  88.57 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000011625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0023  tRNA-Tyr  87.14 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2436  tRNA-Tyr  89.66 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2438  tRNA-Tyr  89.66 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2441  tRNA-Tyr  89.66 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2146  tRNA-Tyr  89.66 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2148  tRNA-Tyr  89.66 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2151  tRNA-Tyr  89.66 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTyr01  tRNA-Tyr  88.57 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618223  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0054  tRNA-Tyr  87.14 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000219013  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0054  tRNA-Tyr  87.14 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000756603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  87.14 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0050  tRNA-Tyr  85.23 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05585  tRNA-Tyr  85.23 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000486194  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0053  tRNA-Tyr  85.23 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0058  tRNA-Tyr  85.23 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0117646  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0059  tRNA-Tyr  85.23 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0065  tRNA-Tyr  91.23 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135481  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0001  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232487  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0010  tRNA-Tyr  89.29 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00640732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0019  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172522  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0010  tRNA-Tyr  87.32 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0014  tRNA-Tyr  87.32 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.64782e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0037  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0466069  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0031  tRNA-Tyr  87.32 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.219663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0006  tRNA-Tyr  88.73 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000157538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0004  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000291052  hitchhiker  0.00000658966 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0308  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.0000522223  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0063  tRNA-Tyr  87.32 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0010  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000639751  normal  0.164042 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0005  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.309794  hitchhiker  0.000058152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0007  tRNA-Tyr  87.93 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0010  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000653583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0021  tRNA-Tyr  89.66 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000249749  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0315  tRNA-Tyr  86.96 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171426  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0053  tRNA-Tyr  88.68 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0012  tRNA-Tyr  96.97 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000201631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0038  tRNA-Tyr  96.97 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481051  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0019  tRNA-Tyr  87.72 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00432304  decreased coverage  0.00738157 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0060  tRNA-Tyr  87.72 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0060  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.500822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0044  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0008  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1874  tRNA-Tyr  86.76 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0618202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0021  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000055523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0056  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0115  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.542258  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  86.57 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00106012  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0040  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4783  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0161693  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0114  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.524989  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0057  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0126  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000000986876  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0075  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0435  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0436  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0434  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168072  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0056  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0055  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0155  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720201  hitchhiker  0.000109312 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0054  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.329016  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0116  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.427011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0014  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000873726  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0067  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11453  normal  0.549704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0066  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.119149  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0117  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.439512  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t04  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t05  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t06  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0048  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0049  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>