298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0045 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0045  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011189  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  88.73 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  97.67 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  88.73 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0038  tRNA-Tyr  97.56 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481051  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0054  tRNA-Tyr  89.23 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000756603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0063  tRNA-Tyr  97.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0054  tRNA-Tyr  89.23 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000219013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0012  tRNA-Tyr  97.56 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000201631  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  86.9 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0027  tRNA-Tyr  95.35 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.645758  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0002  tRNA-Tyr  85.37 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0059  tRNA-Tyr  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000803667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0090  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00740419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0015  tRNA-Tyr  95.12 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000666826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0010  tRNA-Tyr  88.52 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00640732  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna4  tRNA-Tyr  95.12 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  90 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0001  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232487  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  90 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0357  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.189784  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0056  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00201285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0047  tRNA-Tyr  88.14 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0045  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000472337  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0065  tRNA-Tyr  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0021  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000249749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2436  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2438  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2441  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2146  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2148  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2151  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0044  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0060  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.500822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0008  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0021  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000055523  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0058  tRNA-Tyr  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401108  normal  0.738165 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0050  tRNA-Tyr  91.11 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05585  tRNA-Tyr  91.11 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000486194  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0046  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.63004  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0050  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563652  normal  0.998749 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0019  tRNA-Tyr  96.97 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00432304  decreased coverage  0.00738157 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0058  tRNA-Tyr  91.11 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0117646  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0437  tRNA-Tyr  94.59 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253794  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0059  tRNA-Tyr  91.11 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0053  tRNA-Tyr  91.11 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0037  tRNA-Tyr  84.93 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000333812  normal  0.463641 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0008  tRNA-Tyr  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1717  tRNA-Tyr  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000393409  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1468  tRNA-Tyr  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000829322  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1675  tRNA-Tyr  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000825492  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3169t  tRNA-Tyr  90.91 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000963537  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0010  tRNA-Tyr  84.52 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0033  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90982  normal  0.487146 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3167t  tRNA-Tyr  90.91 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000658084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0023  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0059  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111463  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0026  tRNA-Tyr  89.36 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01442  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3797  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000392981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0020  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3087  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000100368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0057  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.343924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01441  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0050  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00161887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0079  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0012  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122749  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0435  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0434  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168072  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00236  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0061  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000782814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0072  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172192  normal  0.224883 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3168t  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 81 bp  54  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0015  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216156  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01443  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0035  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283862  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0063  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01440  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0012  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000828702  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2720  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000267596  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0437  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000091753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0003  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0436  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0012  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000498022  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0060  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000231954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0057  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.658819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3189  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000533959  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0025  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.578313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0068  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.544581  normal  0.0861147 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1903  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000431131  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3207t  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 81 bp  54  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0563071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3765  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3827  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3458  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000255407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>