More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_R0090 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_R0090  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00740419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  90.59 
 
 
85 bp  97.6  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0065  tRNA-Tyr  90.59 
 
 
85 bp  97.6  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  90.8 
 
 
87 bp  95.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0434  tRNA-Tyr  89.41 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna127  tRNA-Tyr  89.41 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000596133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna128  tRNA-Tyr  89.41 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000522671  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0435  tRNA-Tyr  89.41 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000139864  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna126  tRNA-Tyr  89.41 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0010  tRNA-Tyr  89.41 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000639751  normal  0.164042 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0436  tRNA-Tyr  89.41 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2720  tRNA-Tyr  89.41 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000267596  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna049  tRNA-Tyr  89.41 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000729989  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01442  tRNA-Tyr  89.16 
 
 
82 bp  85.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00236  tRNA-Tyr  89.16 
 
 
82 bp  85.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01441  tRNA-Tyr  89.16 
 
 
82 bp  85.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01443  tRNA-Tyr  89.16 
 
 
82 bp  85.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01440  tRNA-Tyr  89.16 
 
 
82 bp  85.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0040  tRNA-Tyr  88.24 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4783  tRNA-Tyr  88.24 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0161693  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0437  tRNA-Tyr  88.24 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000091753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0044  tRNA-Tyr  88.24 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0060  tRNA-Tyr  88.24 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.500822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0033  tRNA-Tyr  88.24 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90982  normal  0.487146 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0059  tRNA-Tyr  90.77 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000803667  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0027  tRNA-Tyr  89.71 
 
 
85 bp  79.8  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.645758  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  90.14 
 
 
88 bp  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  88.51 
 
 
88 bp  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0058  tRNA-Tyr  88.37 
 
 
86 bp  75.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0068  tRNA-Tyr  88.37 
 
 
86 bp  75.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.544581  normal  0.0861147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0031  tRNA-Tyr  87.06 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.219663 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0315  tRNA-Tyr  87.06 
 
 
87 bp  73.8  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171426  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0063  tRNA-Tyr  88.41 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0021  tRNA-Tyr  88.1 
 
 
83 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0029  tRNA-Tyr  88.1 
 
 
83 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572111  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0022  tRNA-Tyr  88.1 
 
 
83 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322461  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0029  tRNA-Tyr  88.1 
 
 
83 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0003  tRNA-Tyr  87.21 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1874  tRNA-Tyr  86.59 
 
 
81 bp  67.9  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0618202  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0058  tRNA-Tyr  88.57 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0117646  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0063  tRNA-Tyr  87.21 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0059  tRNA-Tyr  88.57 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t006  tRNA-Tyr  86.05 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000887423  normal  0.123776 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0012  tRNA-Tyr  88.57 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000201631  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0060  tRNA-Tyr  87.21 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000231954  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0057  tRNA-Tyr  87.21 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.658819  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0045  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011189  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0057  tRNA-Tyr  87.21 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.343924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0050  tRNA-Tyr  87.21 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0039  tRNA-Tyr  87.21 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0056  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0054  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.329016  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0073  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.92183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0126  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000000986876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0071  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.676805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0056  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0055  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337665  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3207t  tRNA-Tyr  95.56 
 
 
81 bp  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0563071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0070  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.531794  normal  0.0573662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0155  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720201  hitchhiker  0.000109312 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0057  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna4  tRNA-Tyr  88.41 
 
 
86 bp  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0072  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.926918 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0114  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.524989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0066  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.119149  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0007  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171771  normal  0.0302346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0117  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.439512  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0001  tRNA-Tyr  93.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0012  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000467845  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0015  tRNA-Tyr  88.41 
 
 
86 bp  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000666826  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0005  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002791  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0074  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.700319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0075  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0076  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0006  tRNA-Tyr  95.56 
 
 
84 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000157538  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3168t  tRNA-Tyr  95.56 
 
 
81 bp  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0116  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.427011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0115  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.542258  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0067  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11453  normal  0.549704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0014  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000873726  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0068  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112006  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTyr01  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
88 bp  65.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618223  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0071  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719638  normal  0.0567471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0069  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.548705  normal  0.0555108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0072  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554165  normal  0.0570473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0010  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0067  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.439921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0068  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.314206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0069  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304114  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0058  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.17611  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0014  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000039467  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17640  tRNA-Tyr  89.47 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0113  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.532695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0132  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000516023  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0050  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.399527  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t04  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t05  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t06  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0048  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0049  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>