142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_R0046 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_R0046  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0057  tRNA-Tyr  98.55 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0059  tRNA-Tyr  98.55 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234282  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0016  tRNA-Tyr  91.03 
 
 		 85 bp  99.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.972544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03440  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 82 bp  99.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21440  tRNA-Tyr  92.75 
 
 		 82 bp  97.6  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000199792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  92.19 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0002  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 86 bp  79.8  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt06  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt10  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.882625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17640  tRNA-Tyr  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193498  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  88.71 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0010  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00640732  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07640  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  0.0415819 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0050  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00161887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0054  tRNA-Tyr  84.15 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0012  tRNA-Tyr  84.15 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787862  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0008  tRNA-Tyr  87.1 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0001  tRNA-Tyr  91.11 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232487  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  88.33 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0045  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0051  tRNA-Tyr  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0652874  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0060  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.500822  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2436  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2438  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2441  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2146  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2148  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2151  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0063  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0027  tRNA-Tyr  85.94 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.645758  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0044  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0021  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000055523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0065  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135481  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1360  tRNA-Tyr  90.91 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0021  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000249749  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0010  tRNA-Tyr  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367926  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05585  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000486194  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000509746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0058  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0117646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3797  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000392981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0020  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3087  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000100368  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0014  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526877  normal  0.0596738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0079  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0059  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0061  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000782814  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0043  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0206397  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0012  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000828702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0011  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000000561505  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0033  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90982  normal  0.487146 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3189  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000533959  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0068  tRNA-Tyr  85.07 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0068  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.544581  normal  0.0861147 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1903  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000431131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3765  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3827  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3458  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000255407  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0009  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000816684  normal  0.0119926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0012  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122749  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0058  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0012  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000498022  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0072  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172192  normal  0.224883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0059  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111463  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0050  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0053  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0042  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0038  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.105251 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna128  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000522671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna127  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000596133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNATyrVIMSS1309201  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0854141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0434  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0435  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0436  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2720  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000267596  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0036  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45022  normal  0.113165 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0029  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00236  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01440  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01441  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01442  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01443  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna049  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000729989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0012  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000201631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0038  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481051  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna126  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0008  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0090  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00740419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0070  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna4  tRNA-Tyr  86.15 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>