More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0111 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0111  dihydropteroate synthase  100 
 
 
490 aa  1003    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.119932 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  39.79 
 
 
436 aa  286  7e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  37.83 
 
 
437 aa  278  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  39.22 
 
 
435 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  36.01 
 
 
272 aa  196  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  37.26 
 
 
400 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2610  dihydropteroate synthase  35.42 
 
 
283 aa  183  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  34.65 
 
 
291 aa  183  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  38.94 
 
 
279 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  34.39 
 
 
279 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0210  dihydropteroate synthase  35.74 
 
 
299 aa  180  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  39.81 
 
 
279 aa  179  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  35.56 
 
 
297 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  40.47 
 
 
271 aa  179  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2625  dihydropteroate synthase  35.76 
 
 
286 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  35.69 
 
 
291 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  38.61 
 
 
294 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  38.05 
 
 
258 aa  177  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  35.28 
 
 
298 aa  177  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  35.6 
 
 
275 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0536  dihydropteroate synthase  37.63 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0712347  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0549  dihydropteroate synthase  37.63 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  34.18 
 
 
283 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  37.46 
 
 
299 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2851  dihydropteroate synthase  34.46 
 
 
293 aa  173  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.668337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  36.22 
 
 
290 aa  174  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  38.02 
 
 
413 aa  174  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  33.88 
 
 
397 aa  173  5.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  34.18 
 
 
283 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  35.28 
 
 
298 aa  172  9e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  35 
 
 
393 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  33.98 
 
 
298 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1513  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 
296 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  36.79 
 
 
265 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  37.3 
 
 
280 aa  171  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1134  dihydropteroate synthase  35.62 
 
 
281 aa  170  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  37.75 
 
 
290 aa  170  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0572  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 
296 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  34.29 
 
 
287 aa  169  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0778  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 
296 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1289  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 
296 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  35.78 
 
 
394 aa  170  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0579  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 
296 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.601672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  36.91 
 
 
296 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0945  dihydropteroate synthase  35.37 
 
 
279 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  38.19 
 
 
287 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  36.1 
 
 
283 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2618  dihydropteroate synthase  35.48 
 
 
292 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.103274  normal  0.519468 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1483  dihydropteroate synthase  36.91 
 
 
296 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  37.54 
 
 
486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  34.67 
 
 
270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  39.27 
 
 
278 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  36.28 
 
 
332 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 
265 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0439  dihydropteroate synthase  33.87 
 
 
385 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00392867  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  34.2 
 
 
274 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  35.41 
 
 
300 aa  166  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0205  dihydropteroate synthase  36.33 
 
 
262 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  38.13 
 
 
276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  33.01 
 
 
307 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  35.05 
 
 
316 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  39.53 
 
 
278 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  34.67 
 
 
267 aa  164  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2022  dihydropteroate synthase  34.7 
 
 
313 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  35.85 
 
 
302 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1175  dihydropteroate synthase  34.7 
 
 
313 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4924  dihydropteroate synthase  32.81 
 
 
278 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0654969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4440  dihydropteroate synthase  34.07 
 
 
299 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943792  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1841  dihydropteroate synthase  34.18 
 
 
368 aa  163  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285015  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0629  dihydropteroate synthase  39.38 
 
 
315 aa  163  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  normal  0.623209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0446  dihydropteroate synthase  36.69 
 
 
286 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5154  dihydropteroate synthase  36.91 
 
 
275 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  36.48 
 
 
285 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1187  dihydropteroate synthase  34.7 
 
 
313 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  33.75 
 
 
283 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4768  dihydropteroate synthase  36.58 
 
 
275 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4854  dihydropteroate synthase  36.58 
 
 
275 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  36.36 
 
 
257 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  34.94 
 
 
412 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  35.76 
 
 
286 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  35.67 
 
 
285 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  33.87 
 
 
277 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4732  dihydropteroate synthase  39.03 
 
 
291 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0090044  decreased coverage  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  34.19 
 
 
283 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  35.67 
 
 
274 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0060  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 
263 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.545012 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  33 
 
 
286 aa  159  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  35.39 
 
 
285 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0982  dihydropteroate synthase  34.73 
 
 
278 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0153  dihydropteroate synthase  34.24 
 
 
272 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.77759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  34.3 
 
 
283 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2012  dihydropteroate synthase  33.13 
 
 
292 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4015  dihydropteroate synthase  38.01 
 
 
283 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  31.51 
 
 
277 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2115  dihydropteroate synthase  36.25 
 
 
282 aa  158  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  33.98 
 
 
283 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1971  dihydropteroate synthase  35.8 
 
 
289 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1851  dihydropteroate synthase  36.75 
 
 
291 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 
278 aa  157  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1298  dihydropteroate synthase  34.16 
 
 
299 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>