More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1723 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1723  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  100 
 
 
275 aa  552  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.120133  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3550  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  59.86 
 
 
286 aa  325  6e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3029  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  54.01 
 
 
283 aa  311  6.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4210  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  54.55 
 
 
283 aa  298  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2592  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  54.36 
 
 
283 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0171535  decreased coverage  0.0000000235348 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0008  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.05 
 
 
283 aa  285  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1339  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.05 
 
 
283 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4512  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.59 
 
 
281 aa  278  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3799  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.16 
 
 
281 aa  278  9e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3076  formamidopyrimidine-DNA glycosylase / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.66 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3369  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  50.17 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5075  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  50.69 
 
 
287 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3659  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  51.52 
 
 
293 aa  269  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.713719999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0596  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  51.62 
 
 
270 aa  265  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.717834  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3307  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  49.66 
 
 
293 aa  261  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4885  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  50.9 
 
 
270 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512414  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0087  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.64 
 
 
291 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0619  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.81 
 
 
293 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0236093  normal  0.724235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4528  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.14 
 
 
296 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.375609 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0048  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.97 
 
 
293 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.683783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2096  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.8 
 
 
293 aa  246  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.026962  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1004  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.44 
 
 
289 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.838734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4100  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.51 
 
 
297 aa  245  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0383  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  49.28 
 
 
270 aa  244  8e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0212  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.31 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_004310  BR2183  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.46 
 
 
293 aa  243  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0716  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.93 
 
 
302 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4046  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.8 
 
 
299 aa  241  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.800255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0452  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.29 
 
 
288 aa  241  9e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.112388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4416  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.46 
 
 
299 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0080  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.47 
 
 
293 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3187  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  50.9 
 
 
270 aa  238  6.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.186382 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0040  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.46 
 
 
293 aa  237  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.733521  normal  0.608589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3033  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.1 
 
 
292 aa  237  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0377  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.47 
 
 
293 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3573  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.55 
 
 
306 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000376379 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03200  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.6 
 
 
271 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4368  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.61 
 
 
301 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4639  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45 
 
 
296 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0230348 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0582  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.36 
 
 
272 aa  228  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7054  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.15 
 
 
297 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0045  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.24 
 
 
270 aa  226  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.890377  normal  0.0669728 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3716  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.64 
 
 
296 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246645  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3749  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.45 
 
 
270 aa  225  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0686  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.6 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.375563  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1158  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.65 
 
 
271 aa  221  9e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.384452  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3072  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.6 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6254  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.96 
 
 
297 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3726  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.58 
 
 
277 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0631  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.17 
 
 
272 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000258604 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1864  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.81 
 
 
271 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00234848  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0389  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.18 
 
 
297 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0319  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.23 
 
 
276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1221  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.23 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1621  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.5 
 
 
275 aa  215  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39022  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0788  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45 
 
 
274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1921  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  39.21 
 
 
280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0319  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  42.81 
 
 
271 aa  212  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4761  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.29 
 
 
270 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0890871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2649  formamidopyrimidine-DNA glycosylase / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.55 
 
 
277 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.849612 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0574  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.23 
 
 
276 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0758  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.23 
 
 
276 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6128  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.04 
 
 
275 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559175  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0590  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.23 
 
 
276 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0479  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.88 
 
 
276 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2023  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.79 
 
 
281 aa  209  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000058867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4197  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.13 
 
 
270 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0104  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.09 
 
 
269 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00316488  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2809  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.68 
 
 
327 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2184  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.68 
 
 
275 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338547  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0517  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.04 
 
 
275 aa  208  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.501091  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2798  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.68 
 
 
275 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3957  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.94 
 
 
269 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2000  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.88 
 
 
271 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2716  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.04 
 
 
275 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  0.175182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2758  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.17 
 
 
270 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04670  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.65 
 
 
270 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2378  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.17 
 
 
270 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.067562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0450  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.65 
 
 
270 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4129  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.82 
 
 
276 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4097  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.45 
 
 
269 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0739878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5429  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.76 
 
 
276 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2858  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.68 
 
 
284 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3690  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.6 
 
 
271 aa  205  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0589  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.46 
 
 
276 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362043  decreased coverage  0.000844173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04870  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  38.35 
 
 
274 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000175141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2469  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.58 
 
 
273 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000327901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0414  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.22 
 
 
270 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0064  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.88 
 
 
269 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000168259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3115  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.88 
 
 
272 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3623  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.57 
 
 
272 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2935  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.88 
 
 
272 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666185  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0083  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.88 
 
 
272 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0058  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.88 
 
 
269 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000284892  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1507  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.88 
 
 
272 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4152  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.88 
 
 
269 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000225921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0117  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.16 
 
 
271 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0117  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.07 
 
 
273 aa  202  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00226258  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5005  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.73 
 
 
269 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000371844  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4136  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.73 
 
 
269 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000871365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>