47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0965 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0965  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  587  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4110  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4787  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0659987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 244 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  37.5 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  37.04 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 219 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.97 
 
 		 233 aa  46.6  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 235 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 242 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 242 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2020  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 236 aa  45.8  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  53.85 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1777  methyltransferase type 11  47.62 
 
 		 191 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 221 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 395 aa  43.5  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  31.68 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  36.07 
 
 		 216 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  44 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  42.22 
 
 		 213 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 324 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  25.3 
 
 		 225 aa  42.7  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.06 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 234 aa  42.7  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  43.9 
 
 		 269 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.77 
 
 		 251 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.77 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.77 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  43.48 
 
 		 258 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36 
 
 		 325 aa  42.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 275 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.77 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.77 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  33.77 
 
 		 251 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.77 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.77 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.77 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>