98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0832 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0832  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0506  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.912825  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0666  integrase, catalytic region  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.760161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0329  integrase, catalytic region  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.209581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2400  hypothetical protein  93.36 
 
 		 286 aa  530  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.415407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2032  integrase, catalytic region  93.71 
 
 		 287 aa  532  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1122  putative transposase protein  63.9 
 
 		 478 aa  358  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0710  putative integrase  63.9 
 
 		 478 aa  358  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112967 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2008  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160475  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2405  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000242595  decreased coverage  0.0000044189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2552  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.338431  normal  0.288762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2837  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3142  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.943926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3931  transposase Tn6049  62.63 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0145396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4424  transposase Tn6049  62.63 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0079465  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5480  transposase Tn6049  62.63 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2000  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6374  transposase Tn6049  62.63 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.038009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0321  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6335  transposase Tn6049  62.63 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000710666  hitchhiker  0.00105142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0099  Integrase catalytic region  63.18 
 
 		 478 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7260  Integrase catalytic region  63.18 
 
 		 478 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0130  Integrase catalytic region  63.18 
 
 		 478 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5181  Integrase catalytic region  63.18 
 
 		 478 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6466  Integrase catalytic region  63.18 
 
 		 478 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6582  Integrase catalytic region  63.18 
 
 		 478 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0318996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0458  integrase catalytic subunit  49.82 
 
 		 484 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0942  integrase catalytic subunit  49.82 
 
 		 484 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1322  integrase catalytic subunit  49.82 
 
 		 484 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1330  integrase catalytic subunit  49.82 
 
 		 484 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2273  integrase catalytic subunit  49.82 
 
 		 484 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2125  integrase catalytic subunit  49.82 
 
 		 484 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2853  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 462 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  28.67 
 
 		 426 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  25.36 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  25.36 
 
 		 417 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  25.36 
 
 		 417 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  24.56 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  24.56 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  24.56 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  24.56 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  25.63 
 
 		 416 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3239  integrase catalytic subunit  27.93 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  27.93 
 
 		 459 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  27.93 
 
 		 459 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  27.93 
 
 		 459 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  27.93 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  25.19 
 
 		 495 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  25.19 
 
 		 493 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  25.19 
 
 		 493 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  29.73 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  27.24 
 
 		 469 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  24.68 
 
 		 380 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  24.1 
 
 		 489 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  26.73 
 
 		 389 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  27.59 
 
 		 400 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0795  Integrase catalytic region  28.66 
 
 		 425 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  29.03 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  29.03 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  29.03 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  29.03 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  29.03 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  29.03 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  29.03 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  29.03 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  29.03 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  27.36 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  27.36 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  27.36 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  27.36 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  27.36 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  26.73 
 
 		 389 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  26.73 
 
 		 389 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  26.73 
 
 		 389 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  24.56 
 
 		 510 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  29.51 
 
 		 383 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  29.11 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  25.14 
 
 		 597 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  27.36 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  27.36 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  27.36 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  27.36 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1761  Integrase catalytic region  26.09 
 
 		 407 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4098  Integrase catalytic region  26.36 
 
 		 399 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  32.93 
 
 		 481 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1834  integrase catalytic subunit  36.54 
 
 		 387 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  27.86 
 
 		 391 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  26.37 
 
 		 607 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1842  integrase catalytic subunit  36.54 
 
 		 387 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  27.86 
 
 		 391 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  27.86 
 
 		 391 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  24.55 
 
 		 284 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1731  integrase catalytic subunit  32.93 
 
 		 426 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.742948  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0622  integrase catalytic subunit  32.93 
 
 		 426 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0635  integrase catalytic subunit  32.93 
 
 		 426 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1778  integrase catalytic subunit  32.93 
 
 		 426 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.12662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1710  integrase catalytic subunit  32.93 
 
 		 426 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  30.47 
 
 		 276 aa  42  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>