3977 genes were found for organism Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Msil_0001  CDS  NC_011666  362  1882  +  1521  chromosomal replication initiation protein  YP_002360348  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0002  CDS  NC_011666  1925  2455  +  531  Holliday junction resolvase  YP_002360349  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0003  CDS  NC_011666  2452  3081  +  630  Holliday junction DNA helicase RuvA  YP_002360350  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0004  CDS  NC_011666  3086  4144  -  1059  putative DNA-binding/iron metalloprotein/AP endonuclease  YP_002360351  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0005    NC_011666  4331  5275  +  945      n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0006  CDS  NC_011666  5278  6039  +  762  uroporphyrinogen III synthase HEM4  YP_002360352  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0007  CDS  NC_011666  6143  7375  +  1233  hypothetical protein  YP_002360353  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0008  CDS  NC_011666  7360  8346  +  987  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  YP_002360354  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0009  CDS  NC_011666  8402  9172  +  771  ABC transporter related  YP_002360355  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0010  CDS  NC_011666  9174  10016  +  843  ABC-2 type transporter  YP_002360356  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0011  CDS  NC_011666  10032  10430  -  399  cytochrome c class I  YP_002360357  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0012  CDS  NC_011666  10582  11637  +  1056  ABC transporter substrate-binding protein  YP_002360358  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0013    NC_011666  11641  12382  +  742      n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0014  CDS  NC_011666  12375  13082  +  708  ABC transporter related  YP_002360359  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0015  CDS  NC_011666  13230  15200  +  1971  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_002360360  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0016  CDS  NC_011666  15420  17210  +  1791  gamma-glutamyltransferase  YP_002360361  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0017  CDS  NC_011666  17215  17604  -  390  hypothetical protein  YP_002360362  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0018  CDS  NC_011666  17751  18722  +  972  MotA/TolQ/ExbB proton channel  YP_002360363  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0019  CDS  NC_011666  18722  19666  +  945  surface presentation of antigens (SPOA) protein  YP_002360364  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0020  CDS  NC_011666  19780  20112  +  333  flagellar motor switch protein FliN  YP_002360365  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0021  CDS  NC_011666  20114  21148  +  1035  flagellar motor switch protein FliG  YP_002360366  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0022  CDS  NC_011666  21165  22244  +  1080  flagellar biosynthesis protein FlhB  YP_002360367  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0023  CDS  NC_011666  22255  22671  +  417  hypothetical protein  YP_002360368  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0024  CDS  NC_011666  22836  23216  +  381  flagellar basal body rod protein FlgB  YP_002360369  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0025  CDS  NC_011666  23220  23642  +  423  flagellar basal body rod protein FlgC  YP_002360370  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0026  CDS  NC_011666  23639  23953  +  315  flagellar hook-basal body complex protein FliE  YP_002360371  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0027  CDS  NC_011666  23974  24762  +  789  flagellar basal body rod protein FlgG  YP_002360372  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0028  CDS  NC_011666  24815  25261  +  447  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  YP_002360373  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0029  CDS  NC_011666  25258  26361  +  1104  flagellar basal body P-ring protein  YP_002360374  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0030  CDS  NC_011666  26437  26970  +  534  hypothetical protein  YP_002360375  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0031  CDS  NC_011666  26971  27672  +  702  flagellar L-ring protein  YP_002360376  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0032  CDS  NC_011666  27885  28391  +  507  flagellar basal body-associated protein FliL  YP_002360377  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0033  CDS  NC_011666  28388  29131  +  744  flagellar biosynthetic protein FliP  YP_002360378  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0034  CDS  NC_011666  29310  30188  +  879  flagellin domain protein  YP_002360379  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0035  CDS  NC_011666  30326  31966  +  1641  flagellar MS-ring protein  YP_002360380  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0036  CDS  NC_011666  31963  32595  +  633  hypothetical protein  YP_002360381  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0037  CDS  NC_011666  32603  33811  +  1209  OmpA/MotB domain protein  YP_002360382  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0038  CDS  NC_011666  33808  35019  +  1212  chemotaxis protein  YP_002360383  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0039  CDS  NC_011666  35016  36743  +  1728  hypothetical protein  YP_002360384  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0040  CDS  NC_011666  36712  37275  +  564  Lytic transglycosylase catalytic  YP_002360385  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0041  CDS  NC_011666  37429  38103  +  675  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_002360386  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0042  CDS  NC_011666  38578  39822  +  1245  flagellar hook protein FlgE  YP_002360387  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0043  CDS  NC_011666  39857  41347  +  1491  flagellar hook-associated protein FlgK  YP_002360388  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0044  CDS  NC_011666  41358  42401  +  1044  flagellar hook-associated protein FlgL  YP_002360389  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0045  CDS  NC_011666  42527  42874  +  348  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  YP_002360390  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0046  CDS  NC_011666  42882  43292  +  411  flagellar biosynthesis repressor FlbT  YP_002360391  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0047  CDS  NC_011666  43318  43725  +  408  flagellar basal body rod modification protein  YP_002360392  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0048  CDS  NC_011666  43722  43988  +  267  flagellar biosynthesis protein FliQ  YP_002360393  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0049  CDS  NC_011666  44459  46549  +  2091  flagellar biosynthesis protein FlhA  YP_002360394  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0050  CDS  NC_011666  46552  47301  +  750  type III secretion system inner membrane R protein  YP_002360395  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0051  CDS  NC_011666  47356  47763  -  408  hypothetical protein  YP_002360396  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0052  CDS  NC_011666  47834  48325  +  492  hypothetical protein  YP_002360397  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0053  CDS  NC_011666  48505  48864  +  360  hypothetical protein  YP_002360398  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0054  CDS  NC_011666  48861  49310  +  450  hypothetical protein  YP_002360399  n/a    normal  0.679685  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0055  CDS  NC_011666  49361  50113  +  753  hypothetical protein  YP_002360400  n/a    normal  0.500323  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0056  CDS  NC_011666  50215  50874  +  660  hypothetical protein  YP_002360401  n/a    normal  0.848105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0057  CDS  NC_011666  51046  51495  -  450  type IV pilus assembly PilZ  YP_002360402  n/a    normal  0.509918  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0058  CDS  NC_011666  52263  53060  +  798  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  YP_002360403  n/a    normal  0.287616  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0059  CDS  NC_011666  53133  53825  +  693  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  YP_002360404  n/a    normal  0.447442  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0060  CDS  NC_011666  53822  54910  +  1089  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  YP_002360405  n/a    normal  0.400858  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0061  CDS  NC_011666  55061  55810  +  750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002360406  n/a    normal  0.212664  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0062  CDS  NC_011666  55871  56212  +  342  putative transcriptional regulator, ArsR family  YP_002360407  n/a    normal  0.174951  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0063  CDS  NC_011666  56189  56905  -  717  ABC transporter related  YP_002360408  n/a    normal  0.270537  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0064  CDS  NC_011666  56902  57699  -  798  ABC transporter related  YP_002360409  n/a    normal  0.220859  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0065  CDS  NC_011666  57696  58544  -  849  inner-membrane translocator  YP_002360410  n/a    normal  0.123483  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0066  CDS  NC_011666  58544  59422  -  879  inner-membrane translocator  YP_002360411  n/a    normal  0.119811  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0067  CDS  NC_011666  59454  60584  -  1131  Extracellular ligand-binding receptor  YP_002360412  n/a    normal  0.188079  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0068  CDS  NC_011666  60879  61571  +  693  hypothetical protein  YP_002360413  n/a    normal  0.150914  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0069  CDS  NC_011666  61632  61892  -  261  hypothetical protein  YP_002360414  n/a    normal  0.174951  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0070  CDS  NC_011666  62109  62930  +  822  inositol monophosphatase  YP_002360415  n/a    normal  0.207628  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0071  CDS  NC_011666  63024  63287  +  264  hypothetical protein  YP_002360416  n/a    normal  0.162913  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0072  CDS  NC_011666  63468  64799  +  1332  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  YP_002360417  n/a    normal  0.238755  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0073  CDS  NC_011666  64854  65075  -  222  hypothetical protein  YP_002360418  n/a    normal  0.22688  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0074  CDS  NC_011666  65345  66112  +  768  alpha/beta hydrolase fold protein  YP_002360419  n/a    normal  0.204649  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0075  CDS  NC_011666  66254  66649  +  396  hypothetical protein  YP_002360420  n/a    normal  0.176037  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0076  CDS  NC_011666  66704  67231  +  528  transferase hexapeptide repeat containing protein  YP_002360421  n/a    normal  0.186497  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0077  CDS  NC_011666  67497  69890  +  2394  putative membrane transporter  YP_002360422  n/a    normal  0.273508  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0078  CDS  NC_011666  69954  70460  -  507  hypothetical protein  YP_002360423  n/a    normal  0.588412  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0079  CDS  NC_011666  70578  70898  -  321  hypothetical protein  YP_002360424  n/a    normal  0.554101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0080  CDS  NC_011666  70996  72276  -  1281  hypothetical protein  YP_002360425  n/a    normal  0.569971  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0081  CDS  NC_011666  72626  73591  -  966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_002360426  n/a    normal  0.384606  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0082  CDS  NC_011666  73682  74740  -  1059  GDP-mannose 4,6-dehydratase  YP_002360427  n/a    normal  0.584203  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0083  CDS  NC_011666  75005  77332  -  2328  malic enzyme  YP_002360428  n/a    normal  0.323745  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0084  CDS  NC_011666  77530  78393  +  864  pantoate--beta-alanine ligase  YP_002360429  n/a    normal  0.458072  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0085  CDS  NC_011666  78421  78744  +  324  acylphosphatase  YP_002360430  n/a    normal  0.49451  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0086  CDS  NC_011666  78875  79054  +  180  hypothetical protein  YP_002360431  n/a    normal  0.617861  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0087  CDS  NC_011666  79140  79556  +  417  hypothetical protein  YP_002360432  n/a    normal  0.830007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0088  CDS  NC_011666  79560  80435  +  876  Beta-lactamase  YP_002360433  n/a    normal  0.748085  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0089    NC_011666  80465  80737  -  273      n/a    normal  0.624512  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0090  CDS  NC_011666  81682  82731  -  1050  pseudouridine synthase, RluA family  YP_002360434  n/a    normal  0.768556  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0091  CDS  NC_011666  82787  83707  -  921  efflux transporter, RND family, MFP subunit  YP_002360435  n/a    normal  0.718467  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0092  CDS  NC_011666  83704  84123  -  420  protein of unknown function DUF305  YP_002360436  n/a    normal  0.62579  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0093  CDS  NC_011666  85094  86326  +  1233  polysaccharide export protein  YP_002360437  n/a    normal  0.249835  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0094  CDS  NC_011666  86677  87972  +  1296  glycosyl transferase group 1  YP_002360438  n/a    normal  0.514117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0095  CDS  NC_011666  87972  88724  +  753  protein of unknown function DUF159  YP_002360439  n/a    normal  0.762329  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0096  CDS  NC_011666  88826  89416  -  591  transcriptional regulator, TetR family  YP_002360440  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0097  CDS  NC_011666  89832  90566  +  735  transcriptional regulator, LuxR family  YP_002360441  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0098  CDS  NC_011666  90840  91457  +  618  autoinducer synthesis protein  YP_002360442  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0099  CDS  NC_011666  91816  92568  +  753  protein of unknown function DUF81  YP_002360443  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Msil_0100  CDS  NC_011666  92594  93580  +  987  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  YP_002360444  n/a    normal  1  Methylocella silvestris BL2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>