27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0075 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0075  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  263  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.176037 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0927  hypothetical protein  76.34 
 
 		 131 aa  209  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23234  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2810  hypothetical protein  46.03 
 
 		 70 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180182  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3207  hypothetical protein  47.62 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5230  hypothetical protein  47.62 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179685  normal  0.0954589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3915  hypothetical protein  47.62 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2136  hypothetical protein  46.03 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.621676  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3143  hypothetical protein  47.62 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3287  hypothetical protein  46.03 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.558617  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2578  hypothetical protein  47.62 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.8763  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2110  hypothetical protein  50.79 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.773759  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2386  hypothetical protein  50.79 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2062  hypothetical protein  50.79 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2175  hypothetical protein  46.03 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3775  hypothetical protein  49.21 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1728  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2628  hypothetical protein  45.9 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253384 
 
 
-
 
NC_004310  BR1261  hypothetical protein  42.42 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1927  hypothetical protein  40.91 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1223  hypothetical protein  42.42 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1569  hypothetical protein  36.51 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0870205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1766  hypothetical protein  38.1 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0831  hypothetical protein  42.62 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0522629  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1114  hypothetical protein  42.42 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1983  hypothetical protein  38.33 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3736  hypothetical protein  38.33 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2541  hypothetical protein  37.29 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>