49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3143 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3143  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 157 aa  316  9e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1257  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 157 aa  316  9e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1374  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 157 aa  316  9e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.719868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3497  hypothetical protein  62.34 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1903  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06045  hypothetical protein  39.86 
 
 		 174 aa  90.5  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1878  hypothetical protein  34 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000380113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2725  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000242715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2308  TPR domain protein  32.58 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0457067  hitchhiker  0.00000000000588055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2937  TPR domain protein  32.58 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2967  TPR domain-containing protein  32.58 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2649  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2974  TPR domain protein  32.58 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2720  TPR domain-containing protein  31.82 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2927  TPR domain protein  31.82 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4835500000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2928  TPR domain-containing protein  31.82 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2671  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01390  hypothetical protein  29.13 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12640  hypothetical protein  33.81 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.80444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4040  hypothetical protein  32.31 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  29.57 
 
 		 341 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 366 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2938  hypothetical protein  30.77 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00841158  hitchhiker  0.000372001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 543 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  28.69 
 
 		 1056 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 636 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2098  tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein  26.6 
 
 		 653 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.903394  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1138 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  29.35 
 
 		 584 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 612 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  28.89 
 
 		 955 aa  44.3  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 4079 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.32 
 
 		 1979 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 927 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3549  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 421 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  31.2 
 
 		 1007 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 750 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.08 
 
 		 568 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 		 568 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 466 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.43 
 
 		 626 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 465 aa  42  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 1085 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 467 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25 
 
 		 764 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  26.98 
 
 		 573 aa  40.8  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.09 
 
 		 476 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 		 1162 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>