82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3315 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  100 
 
 
302 aa  597  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  41.43 
 
 
278 aa  193  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  37.19 
 
 
372 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  36.4 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  30.98 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  32.29 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  28.72 
 
 
330 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  36.92 
 
 
334 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  32.31 
 
 
342 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  29.45 
 
 
339 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  31.91 
 
 
332 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  27.93 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  28.57 
 
 
352 aa  82  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  30.72 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  28.74 
 
 
607 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  32.16 
 
 
346 aa  68.9  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  21.94 
 
 
341 aa  63.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  31.74 
 
 
382 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  27.37 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  27.78 
 
 
568 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  25.61 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  26.58 
 
 
546 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  33.93 
 
 
380 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  26.67 
 
 
569 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  26.61 
 
 
572 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  24.29 
 
 
449 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  27.04 
 
 
572 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  32.69 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  28.21 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  26.72 
 
 
600 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  26.72 
 
 
600 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  32.69 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  32.69 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  36.5 
 
 
410 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  24.66 
 
 
545 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  29.71 
 
 
348 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  28.42 
 
 
348 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  30.39 
 
 
568 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  29.68 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  31.54 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  28.32 
 
 
565 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  22.45 
 
 
605 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  31.72 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  33 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  27.27 
 
 
533 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  32.43 
 
 
342 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  34.69 
 
 
336 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  24.05 
 
 
547 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  33.66 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  27.94 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  31.6 
 
 
261 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  32.31 
 
 
261 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  24.55 
 
 
601 aa  46.6  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  31.72 
 
 
261 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  31.72 
 
 
261 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  31.72 
 
 
261 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  30.82 
 
 
430 aa  46.6  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  27.52 
 
 
449 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  30.51 
 
 
567 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  27.51 
 
 
345 aa  45.8  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  24.34 
 
 
567 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  31.3 
 
 
464 aa  45.8  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  27.17 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  31.17 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  31.47 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  35.92 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  27.04 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  24.17 
 
 
543 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  26.88 
 
 
526 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  32.33 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  32.33 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  32.33 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  32.33 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  32.33 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  23.71 
 
 
347 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.33 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  25.42 
 
 
345 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  23.71 
 
 
347 aa  43.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  34.19 
 
 
384 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.03 
 
 
426 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0995  VacJ-like lipoprotein  28.81 
 
 
747 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.4612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  32.3 
 
 
391 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>