More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4405 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
269 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  62.21 
 
 
272 aa  334  9e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2788  Sec-independent protein translocase TatC  62.64 
 
 
267 aa  321  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23913  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.67 
 
 
266 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.67 
 
 
266 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.81 
 
 
266 aa  319  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.12 
 
 
266 aa  319  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.46 
 
 
274 aa  318  7.999999999999999e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1777  sec-independent periplasmic protein translocase  64.18 
 
 
269 aa  317  9e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0307477  decreased coverage  0.00398359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  62.9 
 
 
271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.941523 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  58.15 
 
 
274 aa  310  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  58.15 
 
 
274 aa  310  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.2 
 
 
264 aa  309  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  57.03 
 
 
288 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2743  Sec-independent protein translocase TatC  63.56 
 
 
272 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.269843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  62.96 
 
 
263 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1790  Sec-independent protein translocase TatC  65.34 
 
 
282 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  64.26 
 
 
269 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.600412  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  56.13 
 
 
270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  61 
 
 
262 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.85 
 
 
263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2515  Sec-independent protein translocase TatC  63.01 
 
 
271 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106541  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.33 
 
 
275 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.61 
 
 
280 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.48 
 
 
275 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  51.78 
 
 
323 aa  258  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.04 
 
 
268 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.81 
 
 
300 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50 
 
 
254 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  46.43 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.94 
 
 
263 aa  218  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  44.79 
 
 
263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  45.16 
 
 
271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  42.75 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  45.16 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1345  sec-independent protein translocase  41.2 
 
 
346 aa  211  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.634552  normal  0.127965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.9 
 
 
280 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  45.45 
 
 
250 aa  209  3e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.6 
 
 
287 aa  208  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  45.38 
 
 
249 aa  204  9e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  49.22 
 
 
279 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  46.4 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_002978  WD0452  MttB family protein  44.58 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  42.52 
 
 
289 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.52 
 
 
289 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.72 
 
 
468 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.67 
 
 
264 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  46.48 
 
 
255 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.75 
 
 
257 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.64 
 
 
257 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  36.6 
 
 
264 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.34 
 
 
252 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.19 
 
 
324 aa  169  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  38.91 
 
 
241 aa  169  6e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  36.8 
 
 
266 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.57 
 
 
262 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.85 
 
 
253 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.7 
 
 
398 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  38.22 
 
 
262 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  40.57 
 
 
250 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.2 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  34.98 
 
 
269 aa  166  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  35.98 
 
 
266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.34 
 
 
256 aa  165  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  38 
 
 
267 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  38 
 
 
267 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.61 
 
 
253 aa  165  9e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.19 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.19 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  42.15 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  41.53 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.5 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  40.16 
 
 
249 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.33 
 
 
259 aa  163  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.15 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.15 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.15 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.15 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.15 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.61 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  36.61 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  35.54 
 
 
266 aa  162  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  39.22 
 
 
251 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  36.8 
 
 
258 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.8 
 
 
258 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.8 
 
 
258 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.8 
 
 
258 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.8 
 
 
258 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  36.8 
 
 
258 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.8 
 
 
258 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.8 
 
 
258 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.8 
 
 
258 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  34.27 
 
 
247 aa  159  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  36.71 
 
 
251 aa  159  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03838  twin arginine-targeting protein translocase TatC  41.67 
 
 
251 aa  159  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  37.5 
 
 
255 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.8 
 
 
258 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.8 
 
 
258 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  36.82 
 
 
250 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  36.88 
 
 
265 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>