34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4293 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  56.8 
 
 		 181 aa  201  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  56.05 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  51.48 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  52.5 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  54.05 
 
 		 180 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  45.61 
 
 		 179 aa  159  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  49.68 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  43.07 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  40.29 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  40.29 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  39.13 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  44.08 
 
 		 152 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  40.56 
 
 		 154 aa  98.6  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  40.85 
 
 		 175 aa  95.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  42.11 
 
 		 152 aa  94.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  39.22 
 
 		 152 aa  85.1  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  40.58 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  33.74 
 
 		 162 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  33.13 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  35.77 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  28.99 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  35.25 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  29.41 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  29.41 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  33.33 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1176  RDD domain-containing protein  33.78 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  31.08 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  30.26 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1297  RDD domain-containing protein  29.05 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2640  hypothetical protein  29.05 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253038  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1205  RDD domain-containing protein  42.17 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  31.43 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06647  hypothetical protein  28.97 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>