46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3268 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 325 aa  632  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.41 
 
 		 332 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.52 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  48.21 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.64 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  43.69 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.76 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.62 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  40.37 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.63 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.2 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.97 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.97 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.41 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  41.79 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  41.81 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  55.03 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  43.25 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.23 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.4 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.06 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  51.08 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  45.78 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.75 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.09 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  30.79 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.43 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.41 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.91 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.03 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.97 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.91 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.08 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2192  hypothetical protein  34.96 
 
 		 311 aa  49.7  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  30.29 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.21 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  31.96 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.49 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.53 
 
 		 322 aa  46.2  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.87 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.91 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0372  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.95 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18784  normal  0.460564 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  30.45 
 
 		 204 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.87 
 
 		 221 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.07 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>