27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1637 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  100 
 
 		 111 aa  217  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  42.57 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  43.75 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  42.22 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  37.38 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  41.98 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  39.76 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  41.05 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  34.94 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  40 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2466  cytochrome c class I  41.03 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  40 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  34.78 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  35.64 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  39.36 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  36.9 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  33.94 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  35 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  24.35 
 
 		 132 aa  44.3  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  35 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  39.18 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  31.43 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  33.03 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  31.46 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  29.49 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  30.77 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  32.14 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>