36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1368 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  338  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  43.89 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  43.03 
 
 
196 aa  111  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  46.67 
 
 
199 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  47.13 
 
 
185 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  48.2 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  46.28 
 
 
210 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  40.83 
 
 
209 aa  91.7  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  49.56 
 
 
205 aa  90.9  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  44.58 
 
 
211 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  42.86 
 
 
177 aa  89  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  44.63 
 
 
165 aa  87.8  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  34.94 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  39.84 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  37.91 
 
 
155 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  37.66 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  42.2 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  36.46 
 
 
199 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  39.18 
 
 
280 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  36.54 
 
 
241 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  32.71 
 
 
219 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  30.95 
 
 
179 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0023  hypothetical protein  33.07 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  29.87 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  29.41 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0710  hypothetical protein  27.43 
 
 
243 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2676  hypothetical protein  30 
 
 
217 aa  42.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5729  hypothetical protein  31.45 
 
 
182 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.687337  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  31.82 
 
 
125 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  30.56 
 
 
171 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3742  hypothetical protein  44.64 
 
 
221 aa  40.8  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.83109  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0973  hypothetical protein  27.36 
 
 
244 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.671171  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2406  hypothetical protein  32.7 
 
 
184 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  0.0117496 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2402  hypothetical protein  32.7 
 
 
184 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2447  hypothetical protein  32.48 
 
 
183 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1790  hypothetical protein  32.7 
 
 
184 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>