81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1092 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  89.3 
 
 		 855 bp  1005    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1092    100 
 
 		 860 bp  1705    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  82.98 
 
 		 783 bp  535  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1042  hypothetical protein  88.46 
 
 		 546 bp  111  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  87.5 
 
 		 873 bp  103  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  91.25 
 
 		 810 bp  103  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  91.25 
 
 		 810 bp  103  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2509  integrase  91.25 
 
 		 696 bp  103  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0263754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  91.25 
 
 		 810 bp  103  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  87.5 
 
 		 873 bp  103  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  87.5 
 
 		 873 bp  103  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  87.5 
 
 		 873 bp  103  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  91.25 
 
 		 810 bp  103  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5450    88.17 
 
 		 789 bp  97.6  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3393  integrase catalytic subunit  86.67 
 
 		 825 bp  97.6  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0782  hypothetical protein  86.67 
 
 		 417 bp  97.6  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  91.04 
 
 		 708 bp  85.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0804  hypothetical protein  86.17 
 
 		 351 bp  83.8  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7887    90.91 
 
 		 637 bp  83.8  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1166  integrase catalytic region  86.02 
 
 		 672 bp  81.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  90.77 
 
 		 873 bp  81.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  90.77 
 
 		 939 bp  81.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  90.77 
 
 		 930 bp  81.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  90.77 
 
 		 930 bp  81.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  90.77 
 
 		 930 bp  81.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  87.5 
 
 		 1118 bp  79.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  87.5 
 
 		 1118 bp  79.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  87.5 
 
 		 1118 bp  79.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  87.5 
 
 		 1118 bp  79.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  87.5 
 
 		 1118 bp  79.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  87.5 
 
 		 1118 bp  79.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  87.5 
 
 		 1118 bp  79.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  87.5 
 
 		 1118 bp  79.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    87.5 
 
 		 2455 bp  79.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  87.5 
 
 		 1118 bp  79.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  87.5 
 
 		 1118 bp  79.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  84.47 
 
 		 930 bp  77.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  89.23 
 
 		 822 bp  73.8  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  89.23 
 
 		 822 bp  73.8  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  89.23 
 
 		 822 bp  73.8  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  89.23 
 
 		 822 bp  73.8  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  89.23 
 
 		 822 bp  73.8  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4170    88.24 
 
 		 216 bp  71.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292465  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2497    89.83 
 
 		 1092 bp  69.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0863968 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5640    89.29 
 
 		 246 bp  63.9  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0381  integrase catalytic subunit  87.5 
 
 		 570 bp  63.9  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1904    83.33 
 
 		 396 bp  63.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  93.02 
 
 		 831 bp  61.9  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  88.14 
 
 		 1182 bp  61.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1036    92.86 
 
 		 1858 bp  60  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1212    92.86 
 
 		 555 bp  60  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129542  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  82.8 
 
 		 795 bp  58  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5058    86.15 
 
 		 585 bp  58  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.527487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  92.68 
 
 		 831 bp  58  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  92.68 
 
 		 831 bp  58  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3869    82.47 
 
 		 982 bp  58  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3888    82.47 
 
 		 955 bp  58  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  92.68 
 
 		 831 bp  58  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0138  integrase catalytic subunit  92.68 
 
 		 831 bp  58  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5713    90.91 
 
 		 1992 bp  56  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  90.91 
 
 		 930 bp  56  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  90.91 
 
 		 1128 bp  56  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  90.91 
 
 		 930 bp  56  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3728  integrase protein  87.5 
 
 		 714 bp  56  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3526  integrase protein  87.5 
 
 		 714 bp  56  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3223  integrase protein  87.5 
 
 		 714 bp  56  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2624  integrase protein  87.5 
 
 		 714 bp  56  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.947279  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  90.91 
 
 		 930 bp  56  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1661  integrase catalytic region  90.91 
 
 		 447 bp  56  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1497    82.83 
 
 		 2972 bp  54  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1903    92.31 
 
 		 183 bp  54  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.224169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5483  putative integrase  100 
 
 		 468 bp  54  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.704423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1902    92.31 
 
 		 363 bp  54  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  86.44 
 
 		 921 bp  54  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2810  integrase  88.89 
 
 		 843 bp  50.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1458    96.55 
 
 		 867 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2693    82.47 
 
 		 268 bp  50.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113528  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 846 bp  50.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  93.75 
 
 		 294 bp  48.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1816    88.64 
 
 		 291 bp  48.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.787707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3626    93.75 
 
 		 825 bp  48.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0381422  normal  0.109331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>