298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1816 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1816    100 
 
 		 291 bp  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.787707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1661  integrase catalytic region  93.45 
 
 		 447 bp  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0188    82.35 
 
 		 279 bp  89.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968127 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1458    89.23 
 
 		 867 bp  73.8  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  93.75 
 
 		 843 bp  71.9  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  90.74 
 
 		 831 bp  67.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0138  integrase catalytic subunit  88.71 
 
 		 831 bp  67.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  88.71 
 
 		 831 bp  67.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  88.71 
 
 		 831 bp  67.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  88.71 
 
 		 831 bp  67.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  90.74 
 
 		 846 bp  67.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1628  ISRSO16-transposase ORFB protein  91.49 
 
 		 810 bp  61.9  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  91.3 
 
 		 1118 bp  60  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  91.3 
 
 		 1118 bp  60  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  91.3 
 
 		 1118 bp  60  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  91.3 
 
 		 1118 bp  60  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    91.3 
 
 		 2455 bp  60  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  91.3 
 
 		 1118 bp  60  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  91.3 
 
 		 1118 bp  60  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  91.3 
 
 		 1118 bp  60  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  91.3 
 
 		 1118 bp  60  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  91.3 
 
 		 1118 bp  60  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  91.3 
 
 		 1118 bp  60  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  90.91 
 
 		 855 bp  56  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1279  putative transposase  85.71 
 
 		 264 bp  54  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0690484  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1360    88.24 
 
 		 261 bp  54  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1036    88.24 
 
 		 1858 bp  54  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0001  integrase core subunit  88.24 
 
 		 615 bp  54  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.274298 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0376  integrase catalytic region  88.24 
 
 		 825 bp  54  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000146675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0125  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128078  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0195  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.434557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0291  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0238689  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0366  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0269645  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0377  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246103  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0464  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0531  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603629  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0629  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000121323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0751  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0782  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1265  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.399396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1345  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1457  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1629  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00878015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1734  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899598  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1746  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1749  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0018  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0545  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0563  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 2394 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0960  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1323  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1483  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 723 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369993  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1522  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2665  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2900  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3103  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3133  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3193  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00220403  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3265  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3298  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3409  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3477  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3492  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3523  A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0008  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0023  IS1404 transposase  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0026  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0068  IS1404 transposase  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0117  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0159  IS1404 transposase  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0183  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0283  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.010372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0301  IS1404 transposase  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0406  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0471  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0565  IS407A, transposase OrfB  94.12 
 
 		 834 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>