21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1036 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1036    100 
 
 		 1858 bp  3683    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1628  ISRSO16-transposase ORFB protein  89.27 
 
 		 810 bp  464  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  89.45 
 
 		 843 bp  456  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1625  remnant of ISRSO16-transposase ORFB protein  89.32 
 
 		 648 bp  234  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4709    88.41 
 
 		 318 bp  220  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225613  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1025    98.21 
 
 		 306 bp  103  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1693  integrase catalytic subunit  79.68 
 
 		 504 bp  93.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0305    92.59 
 
 		 234 bp  75.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  92 
 
 		 831 bp  67.9  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0138  integrase catalytic subunit  90 
 
 		 831 bp  60  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  90 
 
 		 831 bp  60  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  90 
 
 		 831 bp  60  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  90 
 
 		 831 bp  60  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1092    92.86 
 
 		 860 bp  60  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0069  integrase core subunit  89.36 
 
 		 537 bp  54  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.8827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1816    88.24 
 
 		 291 bp  54  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.787707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0067  integrase catalytic region  89.36 
 
 		 756 bp  54  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0133  transposase B  89.36 
 
 		 810 bp  54  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0094  integrase core subunit  89.36 
 
 		 810 bp  54  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.445692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0423  hypothetical protein  87.04 
 
 		 333 bp  52  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178902  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1183    84.38 
 
 		 827 bp  48.1  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>