295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1257 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  100 
 
 		 1118 bp  2216    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  100 
 
 		 1251 bp  2008    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  100 
 
 		 1118 bp  2216    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  100 
 
 		 1118 bp  2216    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  100 
 
 		 1118 bp  2216    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    100 
 
 		 2455 bp  4867    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  100 
 
 		 1118 bp  2216    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  100 
 
 		 1118 bp  2216    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  100 
 
 		 1118 bp  2216    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  100 
 
 		 1118 bp  2216    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  100 
 
 		 1118 bp  2216    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  100 
 
 		 1118 bp  2216    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  100 
 
 		 1251 bp  2008    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  100 
 
 		 1251 bp  2008    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  100 
 
 		 1251 bp  2008    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1737    100 
 
 		 2420 bp  2008    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  100 
 
 		 1251 bp  2008    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5450    82.78 
 
 		 789 bp  111  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3787    86.92 
 
 		 351 bp  101  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283893  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2623  transposase IS3/IS911  89.74 
 
 		 195 bp  91.7  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal  0.218597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3222  transposase IS3/IS911  89.74 
 
 		 195 bp  91.7  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.170867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3527  transposase IS3/IS911  89.74 
 
 		 195 bp  91.7  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3727  transposase IS3/IS911  89.74 
 
 		 195 bp  91.7  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  85.09 
 
 		 783 bp  91.7  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  85.09 
 
 		 855 bp  91.7  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0279    81.88 
 
 		 1215 bp  87.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0829  ISRSO14-transposase ORFA protein  83.74 
 
 		 264 bp  85.7  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1493  ISRSO14-transposase ORFA protein  83.74 
 
 		 264 bp  85.7  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504029  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2406  ISRSO14-transposase ORFA protein  83.74 
 
 		 264 bp  85.7  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1216  ISRSO14-transposase ORFA protein  83.74 
 
 		 264 bp  85.7  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1092    87.5 
 
 		 860 bp  79.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  86.75 
 
 		 1209 bp  77.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1166  integrase catalytic region  84.85 
 
 		 672 bp  77.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0782  hypothetical protein  87.84 
 
 		 417 bp  75.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3393  integrase catalytic subunit  87.84 
 
 		 825 bp  75.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0804  hypothetical protein  89.23 
 
 		 351 bp  73.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  86.84 
 
 		 930 bp  71.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  86.84 
 
 		 930 bp  71.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  86.84 
 
 		 930 bp  71.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4170    88.06 
 
 		 216 bp  69.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292465  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  86.67 
 
 		 921 bp  69.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  88.71 
 
 		 939 bp  67.9  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1497    87.14 
 
 		 2972 bp  67.9  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6341    90.74 
 
 		 367 bp  67.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1467 bp  65.9  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2617    83.51 
 
 		 396 bp  65.9  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  86.96 
 
 		 1254 bp  65.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  86.76 
 
 		 267 bp  63.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8497    93.18 
 
 		 555 bp  63.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1903    86.76 
 
 		 183 bp  63.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.224169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1902    86.76 
 
 		 363 bp  63.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  84.34 
 
 		 267 bp  61.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1914  putative insertion element / transposase  94.87 
 
 		 267 bp  61.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.863357  hitchhiker  0.0000000229131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0463  transposase IS3/IS911 family protein  94.87 
 
 		 267 bp  61.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2103  putative transposase  94.87 
 
 		 267 bp  61.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0726746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0875  transposase IS3/IS911 family protein  94.87 
 
 		 267 bp  61.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  87.3 
 
 		 873 bp  61.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2507  transposase  94.87 
 
 		 267 bp  61.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0154773 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  84.34 
 
 		 267 bp  61.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5640    86.57 
 
 		 246 bp  61.9  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0017  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0059  transposase subfamily protein  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.908412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0153  transposase subfamily protein  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.529754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0618  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0939  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0366914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0961  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.231631  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1195  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0210238  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1268  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.075191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1322  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1380  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1426  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140106  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1487  transposase subfamily protein  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.502382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2352  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2512  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2666  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738555  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2819  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2840  transposase subfamily protein  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000381571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2851  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.481023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2901  transposase subfamily protein  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3021  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3068  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3104  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0809558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3134  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3192  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000461611  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3264  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3299  transposase subfamily protein  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.561119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3410  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3476  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3493  transposase subfamily protein  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3522  transposase subfamily protein  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1473  transposase  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1653  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1689  transposase  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.777002  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1794  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.565942  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1819  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2100  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.612525  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2203  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.533121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0112  transposase  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.74618  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0155  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0187  IS407A, transposase OrfA  82.98 
 
 		 264 bp  60  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0369788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>